NUP35基因|核孔复合体功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
NUP35编码核孔复合体中的核孔蛋白,参与核质运输和细胞周期调控,其异常与多种疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | NUP35 |
|---|---|
| 基因全名 | nucleoporin 35 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 2q35 |
| NCBI Gene ID | 5290 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5290 |
| Ensembl ID | ENSG00000163002 |
| UniProt ID | Q8NFH5 |
| OMIM ID | 608140 |
| HGNC ID | 18005 |
| 基因别名 | NUP53, NP_612116.1 |
基因功能与研究简介
NUP35基因编码核孔复合体(NPC)的一个组成部分,即核孔蛋白35(NUP35)。核孔复合体是细胞核与细胞质之间物质运输的关键通道,NUP35作为NPC的组成部分,参与核质运输、细胞周期调控以及基因表达调控等过程。NUP35的异常表达或突变可能与多种疾病相关,包括癌症和神经系统疾病。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肝细胞癌 | NUP35在肝细胞癌中高表达,可能通过促进细胞增殖和迁移参与肿瘤发生。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | NUP35在结直肠癌中表达上调,与肿瘤分期和预后相关。 | 较强研究证据 |
| 乳腺癌 | NUP35在乳腺癌中表达异常,可能影响细胞周期和凋亡。 | 潜在关联 |
| 神经系统疾病 | NUP35突变可能影响核质运输,与神经发育异常相关。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123A>G (p.Ile41Met) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白结构,功能影响未知 |
| c.456C>T (p.Pro152Leu) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白稳定性,功能影响未知 |
| c.789delC (p.Arg264ValfsTer12) | 移码突变 | 暂无可靠数据 | 可能导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变,如移码突变导致蛋白截短,可能破坏核孔复合体结构,影响核质运输。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明NUP35存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明NUP35存在显性负效应突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005643 (nuclear pore) | • GO:0006810 (transport) |
| • GO:0005634 (nucleus) | • GO:0005515 (protein binding) |
相关通路
• 核孔复合体组装 (Nuclear Pore Complex Assembly)
• 核质运输 (Nucleocytoplasmic Transport)
蛋白质功能简介
NUP35蛋白是核孔复合体的组成部分,分子量约35 kDa。它包含一个N-terminal domain和一个C-terminal domain,参与核孔复合体的组装和稳定。NUP35在细胞周期中表达水平可能发生变化,与细胞增殖和分化相关。