NUP98基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

NUP98基因编码核孔复合体蛋白,参与核质运输和基因表达调控,其融合基因在多种白血病中具有重要致病作用。

基因信息卡

基因符号 NUP98
基因全名 nucleoporin 98 and 96 precursor
基因类型 protein-coding
染色体位置 11p15.4
NCBI Gene ID 4922 ncbi.nlm.nih.gov/gene/4922
Ensembl ID ENSG00000110713
UniProt ID P52948
OMIM ID 601021
HGNC ID 8068
基因别名 ADIR2, NUP96, NUP98-96

基因功能与研究简介

NUP98基因编码核孔复合体(NPC)的一个组成部分,该蛋白在核质运输中发挥关键作用,并参与基因表达调控、细胞周期进程和发育过程。NUP98蛋白包含FG重复序列,这些序列对于核孔复合体的选择性运输至关重要。此外,NUP98基因的染色体易位可产生多种融合基因,这些融合蛋白在白血病发生中起重要作用。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
急性髓系白血病 NUP98融合基因(如NUP98-HOXA9)通过异常转录调控导致白血病发生 已明确致病
急性淋巴细胞白血病 NUP98融合基因(如NUP98-NSD1)与ALL相关 已明确致病
骨髓增生异常综合征 NUP98重排与MDS相关 具有较强研究证据
慢性髓性白血病 NUP98融合基因罕见,但已有报道 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
骨髓 暂无可靠数据 高表达
胸腺 暂无可靠数据 中等表达
脾脏 暂无可靠数据 中等表达
睾丸 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
K562 暂无可靠数据 慢性髓性白血病细胞系
HL-60 暂无可靠数据 急性髓系白血病细胞系
Jurkat 暂无可靠数据 T细胞白血病细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
NUP98-HOXA9融合 染色体易位 t(7;11)(p15;p15) 罕见 Gain of Function
NUP98-NSD1融合 染色体易位 t(5;11)(q35;p15) 罕见 Gain of Function
NUP98-PHF23融合 染色体易位 t(11;17)(p15;p13) 罕见 Gain of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

NUP98功能缺失突变在疾病中报道较少,可能影响核孔复合体功能,但证据有限。

Gain of Function(功能获得,GOF)

NUP98融合蛋白通常获得异常转录激活功能,导致下游基因异常表达,促进白血病发生。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

NUP98融合蛋白可能干扰野生型NUP98功能,但具体机制尚不明确。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005643 nuclear pore • GO:0006810 transport
• GO:0006355 regulation of transcription • DNA-templated
• GO:0005634 nucleus • GO:0005515 protein binding

相关通路

Nuclear pore complex assembly
RNA transport
Gene expression regulation

蛋白质功能简介

NUP98蛋白是核孔复合体的组成部分,包含FG重复序列,参与核质运输。NUP98蛋白还参与基因表达调控,通过与多种转录因子相互作用影响基因转录。NUP98融合蛋白在白血病中异常表达,通过异常转录调控促进肿瘤发生。

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