OAT基因|鸟氨酸氨基转移酶功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
OAT基因编码鸟氨酸氨基转移酶,其突变导致鸟氨酸血症,与视网膜和脑部病变相关。
基因信息卡
| 基因符号 | OAT |
|---|---|
| 基因全名 | ornithine aminotransferase |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 10q26.13 |
| NCBI Gene ID | 4942 ncbi.nlm.nih.gov/gene/4942 |
| Ensembl ID | ENSG00000065154 |
| UniProt ID | P04181 |
| OMIM ID | 613349 |
| HGNC ID | 8091 |
| 基因别名 | HOAT, OATASE, ornithine-oxo-acid aminotransferase |
基因功能与研究简介
OAT基因编码鸟氨酸氨基转移酶(ornithine aminotransferase),该酶是一种线粒体基质酶,催化鸟氨酸与α-酮戊二酸之间的转氨基反应,生成谷氨酸和吡咯啉-5-羧酸(P5C),参与脯氨酸和精氨酸的代谢。该酶在肝脏、肾脏、视网膜等组织中高表达,对维持氨基酸平衡和尿素循环具有重要作用。OAT基因突变可导致鸟氨酸血症(gyrate atrophy of the choroid and retina),这是一种常染色体隐性遗传病,以进行性视网膜萎缩和脉络膜病变为特征,常伴有高鸟氨酸血症。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 鸟氨酸血症(脉络膜和视网膜的旋绕萎缩) | OAT基因突变导致鸟氨酸氨基转移酶活性降低或缺失,引起鸟氨酸在体内蓄积,高鸟氨酸血症损害视网膜色素上皮和脉络膜,导致进行性视力丧失。 | 已明确致病(OMIM 258870) |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 视网膜 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 小肠 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系 |
| ARPE-19 | 暂无可靠数据 | 视网膜色素上皮细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1199G>A (p.Arg400His) | 错义突变 | 常见突变 | 降低酶活性 |
| c.1276C>T (p.Arg426Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,功能丧失 |
| c.1222G>A (p.Gly408Arg) | 错义突变 | 罕见 | 降低酶活性 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
大多数OAT突变导致酶活性降低或缺失,属于功能丧失型突变。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0008483: transaminase activity | • GO:0004587: ornithine-oxo-acid transaminase activity |
| • GO:0005739: mitochondrion | • GO:0006520: cellular amino acid metabolic process |
| • GO:0006591: ornithine metabolic process |
相关通路
• hsa00330: Arginine and proline metabolism
• hsa00220: Arginine biosynthesis
• hsa01100: Metabolic pathways
蛋白质功能简介
OAT蛋白由439个氨基酸组成,分子量约48 kDa,定位于线粒体基质。该酶以同源二聚体形式存在,依赖辅因子磷酸吡哆醛(PLP)催化反应。OAT在尿素循环中参与鸟氨酸的再生,并在脯氨酸合成中提供前体。其活性受底物浓度和激素调节。OAT缺陷导致鸟氨酸积累,影响视网膜和脑部功能。
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