OPTC基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

OPTC基因编码视神经蛋白(Opticin),在眼组织中高表达,参与胶原纤维组装和细胞黏附,与青光眼等眼病相关。

基因信息卡

基因符号 OPTC
基因全名 opticin
基因类型 protein-coding
染色体位置 1q31.1
NCBI Gene ID 5188 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5188
Ensembl ID ENSG00000143127
UniProt ID Q9UBM4
OMIM ID 605921
HGNC ID 8150
基因别名 OPT

基因功能与研究简介

OPTC基因编码视神经蛋白(Opticin),属于富含亮氨酸重复序列(LRR)的蛋白家族,主要在眼组织中表达,尤其是睫状体、视网膜和玻璃体。Opticin参与胶原纤维的组装和细胞外基质的调节,对维持眼组织的正常结构和功能至关重要。研究表明,OPTC基因的突变与青光眼等眼病的发生相关,但其确切机制仍在研究中。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
青光眼 OPTC基因突变可能影响视神经蛋白的功能,导致胶原纤维异常和眼压升高,从而增加青光眼风险。 具有较强研究证据
近视 部分研究提示OPTC基因多态性与近视易感性相关,但证据尚不充分。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
眼(睫状体) 暂无可靠数据 高表达
眼(视网膜) 暂无可靠数据 高表达
眼(玻璃体) 暂无可靠数据 高表达
其他组织 暂无可靠数据 低表达或未检测
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
ARPE-19(视网膜色素上皮细胞) 暂无可靠数据 可能表达
HUVEC(人脐静脉内皮细胞) 暂无可靠数据 低表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.152C>T (p.Pro51Leu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白结构,与青光眼相关
c.412G>A (p.Glu138Lys) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,与青光眼相关
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能缺失):突变导致蛋白功能丧失或降低,可能影响胶原纤维组装,导致眼组织异常。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明OPTC突变具有功能获得效应。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性):目前暂无明确证据表明OPTC突变具有显性负性效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005576(extracellular region) • GO:0005515(protein binding)
• GO:0007155(cell adhesion) • GO:0030198(extracellular matrix organization)

相关通路

暂无明确Pathway ID

蛋白质功能简介

Opticin是一种分泌型糖蛋白,属于小亮氨酸富集蛋白聚糖(SLRP)家族。它含有LRR结构域,能够与胶原纤维结合,调节胶原纤维的直径和组装。Opticin在眼组织中高表达,尤其在玻璃体和睫状体中,对维持眼内结构的稳定性和透明度具有重要作用。此外,Opticin可能参与细胞黏附和信号转导,但其具体功能仍需进一步研究。

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