PABPN1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
PABPN1基因编码多聚腺苷酸结合蛋白核1,参与mRNA多聚腺苷酸化,其异常扩展突变导致眼咽肌营养不良(OPMD)。
基因信息卡
| 基因符号 | PABPN1 |
|---|---|
| 基因全名 | Poly(A) Binding Protein Nuclear 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 14q11.2 |
| NCBI Gene ID | 8106 ncbi.nlm.nih.gov/gene/8106 |
| Ensembl ID | ENSG00000100836 |
| UniProt ID | Q86U42 |
| OMIM ID | 602279 |
| HGNC ID | 8567 |
| 基因别名 | PAB2, PABP2 |
基因功能与研究简介
PABPN1基因编码多聚腺苷酸结合蛋白核1,该蛋白在细胞核中参与mRNA前体的多聚腺苷酸化过程,对mRNA的成熟和稳定性至关重要。PABPN1蛋白包含一个RNA结合结构域和一个卷曲螺旋结构域,能够结合poly(A)尾并促进poly(A)聚合酶的活性。PABPN1基因的突变,尤其是GCG重复序列的异常扩展,与眼咽肌营养不良(OPMD)的发生密切相关。OPMD是一种晚发性常染色体显性遗传病,主要表现为进行性眼睑下垂和吞咽困难。PABPN1蛋白的异常扩展导致其在细胞核内形成聚集物,干扰正常的细胞功能,最终导致肌肉细胞死亡。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 眼咽肌营养不良(Oculopharyngeal Muscular Dystrophy, OPMD) | PABPN1基因第一外显子中GCG三核苷酸重复序列异常扩展(正常为6次,致病扩展为11-18次),导致编码的丙氨酸重复序列延长,使PABPN1蛋白在细胞核内形成不溶性聚集物,干扰mRNA加工和细胞功能,最终导致肌肉细胞死亡。 | 已明确致病 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 骨骼肌 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| C2C12 | 暂无可靠数据 | 小鼠成肌细胞 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| GCG重复扩展(如GCG13) | 三核苷酸重复扩展 | 罕见 | 功能获得性毒性(gain of toxic function),导致蛋白聚集 |
| c.3G>A (p.Ala1Thr) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,但致病性尚不明确 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
暂无明确证据表明PABPN1突变导致功能丧失。
Gain of Function(功能获得,GOF)
GCG重复扩展导致PABPN1蛋白获得毒性功能,形成核内聚集物,干扰细胞正常功能。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明PABPN1突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003723 RNA binding | • GO:0005515 protein binding |
| • GO:0005634 nucleus | • GO:0006397 mRNA processing |
| • GO:0043631 RNA polyadenylation |
相关通路
• mRNA polyadenylation (Reactome: R-HSA-72163)
蛋白质功能简介
PABPN1蛋白由306个氨基酸组成,包含一个N端的卷曲螺旋结构域和一个C端的RNA结合结构域。该蛋白在细胞核中与poly(A)聚合酶相互作用,促进mRNA前体poly(A)尾的合成。PABPN1还参与mRNA的核输出和稳定性调控。在OPMD患者中,PABPN1蛋白的丙氨酸重复扩展导致其构象改变,形成淀粉样纤维聚集,这些聚集物在细胞核中积累,干扰mRNA加工和其他核功能,最终导致细胞死亡。
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