PACC1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
PACC1(PPP1R13B)是p53凋亡通路的关键调控因子,参与细胞应激反应和肿瘤发生,是癌症研究的重要靶点。
基因信息卡
| 基因符号 | PACC1 |
|---|---|
| 基因全名 | PPP1R13B (protein phosphatase 1 regulatory subunit 13B) |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 14q32.33 |
| NCBI Gene ID | 23368 ncbi.nlm.nih.gov/gene/23368 |
| Ensembl ID | ENSG00000100811 |
| UniProt ID | Q8N5J2 |
| OMIM ID | 607453 |
| HGNC ID | 14936 |
| 基因别名 | PPP1R13B, ASPP1, FLJ10718 |
基因功能与研究简介
PACC1(PPP1R13B)编码p53凋亡刺激蛋白1(ASPP1),是p53的关键共激活因子。ASPP1通过增强p53对促凋亡基因启动子的结合,促进细胞凋亡。PACC1在多种肿瘤中表达下调,与肿瘤发生发展密切相关。该基因参与细胞应激反应、DNA损伤修复和凋亡调控,是癌症研究的重要靶点。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 乳腺癌 | PACC1表达下调导致p53凋亡功能受损,促进肿瘤发生发展 | 较强研究证据 |
| 肺癌 | PACC1表达降低与肺癌预后不良相关,可能通过抑制凋亡促进肿瘤进展 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | PACC1表达下调与结直肠癌恶性程度相关,参与p53通路调控 | 潜在关联 |
| 肝癌 | PACC1表达异常与肝癌发生相关,可能通过调控凋亡影响肿瘤进展 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.Thr412Ala) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,但具体影响未知 |
| c.567C>T (p.Arg189Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,可能丧失功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
PACC1功能缺失突变(如无义突变)导致ASPP1蛋白截短或降解,丧失促进p53凋亡的功能,可能增加肿瘤风险。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明PACC1存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明PACC1突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005737 (cytoplasm) |
| • GO:0005634 (nucleus) | • GO:0043065 (positive regulation of apoptotic process) |
| • GO:0006974 (cellular response to DNA damage stimulus) |
相关通路
• p53 signaling pathway (KEGG: hsa04115)
• Apoptosis (KEGG: hsa04210)
蛋白质功能简介
PACC1编码的ASPP1蛋白包含锚蛋白重复序列和SH3结构域,通过与p53结合增强其转录活性,促进促凋亡基因的表达。ASPP1在正常组织中表达较高,在多种肿瘤中表达下调,其表达水平与肿瘤预后相关。ASPP1还参与调控细胞周期和DNA损伤应答。