PACRG基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
PACRG(PARK2共调控基因)与帕金森病、肿瘤及纤毛功能密切相关,是神经退行性疾病和癌症研究的重要靶点。
基因信息卡
| 基因符号 | PACRG |
|---|---|
| 基因全名 | PARK2 co-regulated gene |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 6q26 |
| NCBI Gene ID | 135138 ncbi.nlm.nih.gov/gene/135138 |
| Ensembl ID | ENSG00000112561 |
| UniProt ID | Q96M27 |
| OMIM ID | 608427 |
| HGNC ID | 20777 |
| 基因别名 | GLUP, PARK2CR, HAK005771 |
基因功能与研究简介
PACRG(PARK2 co-regulated gene)基因位于染色体6q26,与帕金森病相关基因PARK2(Parkin)共享双向启动子区域,两者协同调控。PACRG编码的蛋白参与纤毛形成、细胞凋亡和微管动力学调控。研究表明,PACRG在多种肿瘤中表达异常,并与帕金森病的发病风险相关。此外,PACRG还参与炎症反应和免疫调节。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 帕金森病 | PACRG与PARK2共享启动子,其表达变化可能影响PARK2功能,参与帕金森病的发病机制。 | 具有较强研究证据 |
| 肝细胞癌 | PACRG在肝细胞癌中表达下调,可能通过影响细胞凋亡和增殖参与肿瘤发生。 | 具有较强研究证据 |
| 结直肠癌 | PACRG在结直肠癌中表达异常,与肿瘤分期和预后相关。 | 具有较强研究证据 |
| 肺癌 | PACRG在肺癌中表达下调,可能作为肿瘤抑制因子。 | 潜在关联 |
| 肾细胞癌 | PACRG在肾细胞癌中表达降低,可能参与肿瘤进展。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 人胚肾细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| rs10945859 | SNV | 未知 | 位于启动子区域,可能影响PACRG表达,与帕金森病风险相关 |
| rs13201099 | SNV | 未知 | 位于内含子区域,可能影响剪接或调控,与帕金森病风险相关 |
| rs11756438 | SNV | 未知 | 位于3'UTR,可能影响miRNA结合,与肿瘤风险相关 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变:导致PACRG蛋白表达减少或功能丧失,可能促进肿瘤发生或影响纤毛形成。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变:目前暂无明确证据表明PACRG存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变:目前暂无明确证据表明PACRG存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005813 (centrosome) | • GO:0005929 (cilium) |
| • GO:0006915 (apoptotic process) | • GO:0008017 (microtubule binding) |
| • GO:0005737 (cytoplasm) |
相关通路
• hsa05012 (Parkinson disease)
• hsa05200 (Pathways in cancer)
• hsa04144 (Endocytosis)
蛋白质功能简介
PACRG蛋白由约270个氨基酸组成,含有卷曲螺旋结构域,定位于中心体和纤毛基部。它参与纤毛的形成和稳定,调节微管动力学,并在细胞凋亡中发挥作用。PACRG与PARK2蛋白相互作用,可能协同参与泛素-蛋白酶体系统。在肿瘤中,PACRG表达下调可能通过影响细胞周期和凋亡促进肿瘤进展。
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