PACSIN1基因|功能、疾病关联、突变与表达研究

PACSIN1编码的蛋白激酶C和酪蛋白激酶底物在神经元中参与膜运输和细胞骨架重塑,与神经系统疾病和癌症相关。

基因信息卡

基因符号 PACSIN1
基因全名 protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 1
基因类型 protein coding
染色体位置 6p21.31
NCBI Gene ID 29993 ncbi.nlm.nih.gov/gene/29993
Ensembl ID ENSG00000112210
UniProt ID Q9BY11
OMIM ID 606592
HGNC ID 8570
基因别名 SDPR; Syndapin I; KIAA1379

基因功能与研究简介

PACSIN1(protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 1)基因编码一种主要在神经元中表达的蛋白,属于PACSIN家族。该蛋白参与膜运输、内吞作用、细胞骨架重塑以及突触囊泡循环。PACSIN1通过其F-BAR结构域与细胞膜和肌动蛋白细胞骨架相互作用,调节细胞形态和信号转导。研究表明,PACSIN1在神经发育和突触可塑性中发挥重要作用,其表达异常与多种神经系统疾病相关。此外,PACSIN1在多种癌症中表达失调,可能参与肿瘤进展。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
精神分裂症 PACSIN1基因变异可能影响突触功能,增加精神分裂症风险。 较强研究证据
阿尔茨海默病 PACSIN1表达水平在阿尔茨海默病患者脑中改变,可能参与神经退行性过程。 潜在关联
帕金森病 PACSIN1与α-突触核蛋白相互作用,可能影响路易小体形成。 潜在关联
癌症 PACSIN1在多种癌症中表达异常,可能通过调节细胞骨架和膜运输影响肿瘤侵袭和转移。 癌症相关

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 低表达
暂无可靠数据 低表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
PC12 暂无可靠数据 大鼠嗜铬细胞瘤细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
rs3744730 SNP 暂无可靠数据 可能影响PACSIN1表达或功能,与精神分裂症相关
rs10494366 SNP 暂无可靠数据 可能影响PACSIN1剪接或表达
c.1234A>G (p.I412V) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白结构或功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变可能导致PACSIN1蛋白活性降低或丧失,影响膜运输和细胞骨架重塑,可能与神经发育异常相关。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变可能增强PACSIN1的活性,导致异常的信号传导或细胞形态改变,但具体证据尚不充分。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变可能干扰正常PACSIN1蛋白的功能,影响其与配体的相互作用,但具体实例尚不明确。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0005737 cytoplasm
• GO:0005886 plasma membrane • GO:0006897 endocytosis
• GO:0030036 actin cytoskeleton organization • GO:0045202 synapse

相关通路

Endocytosis
Actin cytoskeleton regulation
Synaptic vesicle cycle

蛋白质功能简介

PACSIN1蛋白(UniProt Q9BY11)由441个氨基酸组成,包含F-BAR结构域和SH3结构域。F-BAR结构域介导膜弯曲和结合,SH3结构域与多种蛋白相互作用,如dynamin、synaptojanin等。PACSIN1在神经元中高表达,参与突触囊泡的内吞和循环,调节肌动蛋白细胞骨架的动态。此外,PACSIN1还参与细胞迁移和侵袭,在癌症中可能发挥促癌或抑癌作用,具体取决于细胞环境。

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