PAF1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

PAF1是RNA聚合酶II相关因子1,参与转录延伸和染色质修饰,与多种癌症和发育过程相关。

基因信息卡

基因符号 PAF1
基因全名 RNA polymerase II-associated factor 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 19q13.2
NCBI Gene ID 54623 ncbi.nlm.nih.gov/gene/54623
Ensembl ID ENSG00000105662
UniProt ID Q8N7H5
OMIM ID 610506
HGNC ID 28879
基因别名 PD2, hPAF1

基因功能与研究简介

PAF1(RNA聚合酶II相关因子1)是PAF1复合物的核心亚基,该复合物在转录延伸、mRNA加工和染色质修饰中发挥关键作用。PAF1通过与RNA聚合酶II相互作用,调控基因表达,并参与细胞周期、分化和应激反应。研究表明,PAF1在多种癌症中异常表达,影响肿瘤发生和发展。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 PAF1在多种癌症中表达失调,可能通过调控MYC等癌基因表达促进肿瘤发生。 较强研究证据
发育异常 PAF1缺失导致胚胎发育异常,提示其在发育中的重要作用。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚胎肾细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234C>T (p.Arg412Ter) 无义突变 罕见 可能导致截短蛋白,功能丧失
c.567_568del (p.Glu190fs) 移码突变 罕见 可能导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,如无义或移码突变,导致PAF1蛋白功能缺失,可能影响转录调控。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0006351 - transcription • DNA-templated
• GO:0006355 - regulation of transcription • DNA-templated
• GO:0006366 - transcription by RNA polymerase II • GO:0006325 - chromatin organization
• GO:0005515 - protein binding

相关通路

hsa03022 - Basal transcription factors
hsa03040 - Spliceosome

蛋白质功能简介

PAF1蛋白是PAF1复合物的核心成分,该复合物与RNA聚合酶II相互作用,参与转录延伸和染色质修饰。PAF1通过调控基因表达影响细胞增殖、分化和凋亡。在癌症中,PAF1的异常表达可能通过影响MYC等关键基因的转录而促进肿瘤进展。

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