PALB2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
PALB2是BRCA2的合作伙伴和定位蛋白,在DNA双链断裂修复中发挥关键作用,其突变与乳腺癌、胰腺癌等遗传性癌症风险显著相关。
基因信息卡
| 基因符号 | PALB2 |
|---|---|
| 基因全名 | partner and localizer of BRCA2 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 16p12.2 |
| NCBI Gene ID | 79728 ncbi.nlm.nih.gov/gene/79728 |
| Ensembl ID | ENSG00000183087 |
| UniProt ID | Q86YC2 |
| OMIM ID | 610355 |
| HGNC ID | 24744 |
| 基因别名 | FANCN; FLJ21816; MGC166083 |
基因功能与研究简介
PALB2(partner and localizer of BRCA2)基因编码一种与BRCA2相互作用的蛋白质,在DNA双链断裂的同源重组修复中起关键作用。PALB2作为BRCA1和BRCA2之间的桥梁,促进BRCA2-RAD51复合物的形成,从而介导DNA修复。PALB2突变与遗传性乳腺癌、胰腺癌等癌症风险增加相关,同时PALB2也是范可尼贫血互补群N(FANCN)的致病基因。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 遗传性乳腺癌 | PALB2致病性突变导致DNA修复缺陷,增加乳腺癌风险,尤其对家族性乳腺癌风险显著。 | 已明确致病 |
| 遗传性胰腺癌 | PALB2突变是家族性胰腺癌的重要易感因素,增加胰腺癌发病风险。 | 已明确致病 |
| 范可尼贫血互补群N | PALB2双等位基因突变导致范可尼贫血,表现为骨髓衰竭、发育异常和癌症易感性。 | 已明确致病 |
| 卵巢癌 | PALB2突变可能增加卵巢癌风险,但证据强度相对较弱。 | 具有较强研究证据 |
| 前列腺癌 | PALB2突变与前列腺癌风险增加相关,但证据尚不充分。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 胰腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 卵巢 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| PANC-1 | 暂无可靠数据 | 胰腺癌细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.3113G>A (p.Trp1038*) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1592delT (p.Leu531Cysfs*31) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.2323C>T (p.Gln775*) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.49C>T (p.Gln17*) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
PALB2突变通常导致功能丧失,破坏BRCA2相互作用或DNA修复功能,增加癌症风险。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明PALB2存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明PALB2突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0006310 (DNA recombination) |
| • GO:0006281 (DNA repair) | • GO:0000724 (double-strand break repair via homologous recombination) |
| • GO:0005634 (nucleus) |
相关通路
• Homologous recombination repair (Reactome: R-HSA-5693538)
• Fanconi anemia pathway (KEGG: hsa03460)
• BRCA1-associated genome surveillance complex (BASC)
蛋白质功能简介
PALB2蛋白由1186个氨基酸组成,包含多个功能域:N端有coiled-coil结构域,与BRCA1相互作用;中间区域与BRCA2结合;C端有WD40重复序列,参与DNA修复。PALB2作为BRCA1和BRCA2的桥梁,促进RAD51招募至DNA损伤位点,在同源重组修复中发挥关键作用。