PALMD基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究

PALMD基因编码palmdelphin蛋白,参与细胞骨架组织与细胞形态调控,与多种疾病相关。

基因信息卡

基因符号 PALMD
基因全名 palmdelphin
基因类型 protein-coding
染色体位置 1p21.2
NCBI Gene ID 54873 ncbi.nlm.nih.gov/gene/54873
Ensembl ID ENSG00000117616
UniProt ID Q9Y6A5
OMIM ID 614700
HGNC ID 23381
基因别名 C1orf56, FLJ10761, MGC117215

基因功能与研究简介

PALMD基因编码palmdelphin蛋白,属于palmdelphin家族。该蛋白在细胞骨架组织、细胞形态调控和细胞迁移中发挥重要作用。PALMD在多种组织中表达,尤其在心脏、骨骼肌和脑组织中高表达。研究表明,PALMD与多种疾病相关,包括心血管疾病、神经系统疾病和癌症。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
冠状动脉疾病 PALMD基因变异与冠状动脉疾病风险相关,可能通过影响血管平滑肌细胞功能参与疾病发生。 GWAS研究,PMID: 26343387
扩张型心肌病 PALMD表达异常与扩张型心肌病相关,可能参与心肌细胞骨架稳定性的调控。 表达研究,PMID: 29187730
阿尔茨海默病 PALMD在脑组织中表达,可能参与神经元形态维持,与阿尔茨海默病存在潜在关联。 表达研究,PMID: 30804561
癌症 PALMD在多种癌症中表达异常,可能通过影响细胞迁移和侵袭参与肿瘤进展。 表达研究,PMID: 31578313

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
心脏 暂无可靠数据 高表达
骨骼肌 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
肝脏 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HUVEC 暂无可靠数据 内皮细胞
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
rs3742207 SNV 常见变异 与冠状动脉疾病风险相关,可能影响PALMD表达或功能。
rs117026326 SNV 低频变异 与扩张型心肌病相关,可能影响蛋白结构。
rs143918452 SNV 低频变异 与阿尔茨海默病相关,可能影响神经元功能。
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

暂无明确证据

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005737 (cytoplasm) • GO:0005856 (cytoskeleton)
• GO:0005515 (protein binding) • GO:0003779 (actin binding)

相关通路

暂无明确通路

蛋白质功能简介

PALMD编码的palmdelphin蛋白含有PDZ结构域,参与蛋白-蛋白相互作用。该蛋白定位于细胞质,与肌动蛋白细胞骨架相关,可能在细胞形态和迁移中发挥作用。

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