PAN3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
PAN3是poly(A)特异性核糖核酸酶(PAN)复合物的非催化亚基,参与mRNA poly(A)尾的缩短,调控基因表达,与细胞增殖和分化相关。
基因信息卡
| 基因符号 | PAN3 |
|---|---|
| 基因全名 | poly(A) specific ribonuclease subunit PAN3 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 13q12.2 |
| NCBI Gene ID | 255919 ncbi.nlm.nih.gov/gene/255919 |
| Ensembl ID | ENSG00000152518 |
| UniProt ID | Q58FA0 |
| OMIM ID | 暂无可靠数据 |
| HGNC ID | 28749 |
| 基因别名 | PAN3, PAN deadenylation complex subunit |
基因功能与研究简介
PAN3是poly(A)特异性核糖核酸酶(PAN)复合物的非催化亚基,与催化亚基PAN2形成异二聚体,参与mRNA poly(A)尾的缩短,从而调控mRNA的稳定性和翻译效率。PAN3在细胞增殖、分化和应激反应中发挥重要作用。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 暂无明确疾病关联 | 暂无可靠数据 | 暂无明确证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| 暂无明确致病突变 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变(Loss of Function):可能导致PAN复合物活性降低,影响mRNA poly(A)尾的缩短,进而影响基因表达调控。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变(Gain of Function):暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变(Dominant Negative):暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0000287 magnesium ion binding | • GO:0003723 RNA binding |
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0005634 nucleus |
| • GO:0005737 cytoplasm | • GO:0005847 mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex |
| • GO:0006397 mRNA processing | • GO:0031124 mRNA 3'-end processing |
| • GO:0034427 nuclear-transcribed mRNA catabolic process | • exonucleolytic |
| • 3'-5' | • GO:0071042 nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening |
相关通路
• mRNA surveillance pathway (hsa03015)
• RNA degradation (hsa03018)
蛋白质功能简介
PAN3是PAN2-PAN3去腺苷化酶复合物的非催化亚基,负责将复合物锚定到核糖体上,并促进PAN2的催化活性。PAN3包含一个锌指结构域和一个假激酶结构域,可能参与蛋白质-蛋白质相互作用和RNA结合。PAN3在细胞质中与核糖体结合,参与mRNA poly(A)尾的缩短,从而影响mRNA的稳定性和翻译效率。
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