PAPLN基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究
PAPLN编码一种细胞外基质蛋白,参与组织重塑和细胞黏附,与多种癌症及纤维化疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | PAPLN |
|---|---|
| 基因全名 | papilin, proteoglycan-like sulfated glycoprotein |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 14q24.2 |
| NCBI Gene ID | 89932 ncbi.nlm.nih.gov/gene/89932 |
| Ensembl ID | ENSG00000100767 |
| UniProt ID | Q9BWW8 |
| OMIM ID | 610825 |
| HGNC ID | 26017 |
| 基因别名 | FLJ21986, MGC126851 |
基因功能与研究简介
PAPLN基因编码papilin蛋白,一种细胞外基质中的硫酸化糖蛋白,属于ADAMTS样蛋白家族。papilin参与细胞外基质的组装和重塑,影响细胞黏附、迁移和组织发育。研究表明PAPLN在多种肿瘤中表达异常,与肿瘤进展和纤维化疾病相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肝细胞癌 | PAPLN在肝细胞癌中高表达,可能通过促进细胞外基质重塑和上皮-间质转化(EMT)促进肿瘤侵袭和转移。 | 较强研究证据 |
| 胰腺癌 | PAPLN在胰腺癌中表达上调,与肿瘤分期和不良预后相关,可能参与肿瘤微环境调控。 | 较强研究证据 |
| 肺纤维化 | PAPLN在肺纤维化组织中表达增加,可能参与纤维化过程中的基质沉积。 | 潜在关联 |
| 结直肠癌 | PAPLN在结直肠癌中表达异常,可能影响肿瘤细胞增殖和迁移。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 胰腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| PANC-1 | 暂无可靠数据 | 胰腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.Thr412Ala) | SNV | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白结构,功能影响未知 |
| c.456C>T (p.Pro152Leu) | SNV | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白稳定性,功能影响未知 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
暂无明确证据表明PAPLN突变导致功能缺失。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明PAPLN突变导致功能获得。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明PAPLN突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005576 (extracellular region) | • GO:0005615 (extracellular space) |
| • GO:0007155 (cell adhesion) | • GO:0030198 (extracellular matrix organization) |
相关通路
• ECM-receptor interaction (hsa04512)
• Focal adhesion (hsa04510)
• PI3K-Akt signaling pathway (hsa04151)
蛋白质功能简介
PAPLN编码的papilin蛋白是一种细胞外基质糖蛋白,含有多个结构域,包括Kunitz型蛋白酶抑制剂结构域和类似ADAMTS的金属蛋白酶结构域。papilin可能通过调节基质金属蛋白酶活性或与其他基质蛋白相互作用,参与细胞外基质的降解和重塑,从而影响细胞迁移和组织形态发生。