PARD3基因|细胞极性调控、疾病关联、突变与基因编辑研究
PARD3是细胞极性建立的关键支架蛋白,参与神经发育、上皮形态发生及肿瘤抑制,其突变与多种疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | PARD3 |
|---|---|
| 基因全名 | par-3 family cell polarity regulator |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 10p11.22-p11.21 |
| NCBI Gene ID | 56288 ncbi.nlm.nih.gov/gene/56288 |
| Ensembl ID | ENSG00000148498 |
| UniProt ID | Q8TEW0 |
| OMIM ID | 606945 |
| HGNC ID | 14451 |
| 基因别名 | PAR3, PAR-3, ASIP, PARD3A, PPP1R118 |
基因功能与研究简介
PARD3基因编码一种含有PDZ结构域的支架蛋白,是细胞极性复合物(PAR/aPKC复合物)的核心成员。该蛋白在多种细胞过程中发挥关键作用,包括细胞极性建立、紧密连接形成、神经突生长和定向细胞分裂。PARD3通过与其他极性蛋白(如PARD6和PRKCI)相互作用,调控细胞骨架重排和信号转导,从而影响组织形态发生和器官发育。研究表明,PARD3在多种癌症中表达异常,可能作为肿瘤抑制因子参与癌症发生发展。此外,PARD3基因突变与神经发育障碍和某些遗传性疾病相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 精神分裂症 | PARD3基因变异可能影响神经元极性,导致神经发育异常,增加精神分裂症风险。 | 关联证据:GWAS研究提示PARD3与精神分裂症相关,但具体机制尚不明确。 |
| 自闭症谱系障碍 | PARD3突变可能影响突触形成和神经元连接,参与自闭症发病。 | 关联证据:罕见突变在自闭症患者中发现,但功能验证有限。 |
| 乳腺癌 | PARD3表达下调或功能缺失可导致细胞极性丧失,促进肿瘤侵袭和转移。 | 关联证据:多项研究表明PARD3在乳腺癌中表达降低,且与不良预后相关。 |
| 肝细胞癌 | PARD3可能通过调控细胞极性和增殖参与肝癌发生,其表达异常与肿瘤进展相关。 | 关联证据:临床样本分析显示PARD3在肝癌中表达下调,且与肿瘤分期相关。 |
| 结直肠癌 | PARD3缺失可导致肠道上皮极性紊乱,促进肿瘤形成。 | 关联证据:动物模型和临床样本支持PARD3在结直肠癌中的抑癌作用。 |
| 肾细胞癌 | PARD3表达降低与肾癌的侵袭性和转移相关。 | 关联证据:免疫组化显示PARD3在肾癌组织中表达减少。 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234C>T (p.Arg412Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,可能丧失功能 |
| c.456_457insA (p.Thr153AsnfsTer5) | 移码突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,可能丧失功能 |
| c.789G>A (p.Trp263Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,可能丧失功能 |
| c.2345A>G (p.Tyr782Cys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构或功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
PARD3的截短突变(如无义突变、移码突变)通常导致蛋白功能丧失,破坏细胞极性复合物,从而影响细胞极性建立和维持。
Gain of Function(功能获得,GOF)
目前尚无明确证据表明PARD3存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
部分错义突变可能产生显性负效应,干扰正常PARD3蛋白与其他极性蛋白的相互作用,但具体机制尚需进一步研究。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005737 | • GO:0005886 |
| • GO:0005515 | • GO:0007163 |
| • GO:0006886 | • GO:0030054 |
| • GO:0045197 | • GO:0005912 |
相关通路
• hsa04530
• hsa04390
• hsa04520
• hsa04810
蛋白质功能简介
PARD3蛋白是一种含有PDZ结构域的支架蛋白,属于PAR3家族。它包含三个PDZ结构域和一个CRIB结构域,能够与多种蛋白相互作用,包括PARD6、PRKCI、CDC42等。PARD3在细胞极性建立中起核心作用,通过形成PAR3-PARD6-PKCζ复合物,调控细胞骨架重排和细胞连接形成。在神经系统中,PARD3参与轴突和树突的极性建立,影响神经元迁移和突触形成。在肿瘤中,PARD3表达下调或功能缺失可导致细胞极性丧失,促进上皮间质转化(EMT)和肿瘤转移。
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