PARN基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
PARN基因编码多聚腺苷酸特异性核糖核酸酶,参与mRNA的3'端加工和稳定性调控,其突变与端粒生物学障碍及多种疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | PARN |
|---|---|
| 基因全名 | poly(A)-specific ribonuclease |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 16p13.13 |
| NCBI Gene ID | 5071 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5071 |
| Ensembl ID | ENSG00000140694 |
| UniProt ID | O95453 |
| OMIM ID | 604212 |
| HGNC ID | 8609 |
| 基因别名 | DKFZp434H082, PARN, poly(A)-specific ribonuclease |
基因功能与研究简介
PARN基因编码多聚腺苷酸特异性核糖核酸酶,属于DEDD家族核酸外切酶。该酶主要参与mRNA的3'端poly(A)尾的缩短和降解,调控mRNA的稳定性和翻译效率。此外,PARN还参与端粒酶RNA组分(TERC)的3'端加工,影响端粒酶活性。PARN基因突变可导致端粒生物学障碍,与多种疾病相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 特发性肺纤维化 | PARN突变导致端粒酶RNA加工异常,端粒缩短,引发肺纤维化。 | 已明确致病 |
| 骨髓增生异常综合征 | PARN突变影响造血干细胞功能,导致骨髓衰竭。 | 已明确致病 |
| 再生障碍性贫血 | PARN突变导致端粒缩短,造血干细胞耗竭。 | 已明确致病 |
| 肝纤维化 | PARN突变可能通过端粒功能障碍导致肝纤维化。 | 具有较强研究证据 |
| 癌症 | PARN表达异常与多种癌症相关,但具体机制尚不明确。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1A>G (p.Met1?) | 起始密码子突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.2T>C (p.Met1?) | 起始密码子突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.3G>A (p.Met1?) | 起始密码子突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
PARN突变导致蛋白功能丧失,影响mRNA和TERC加工,导致端粒缩短。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004518 nuclease activity | • GO:0000287 magnesium ion binding |
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0006397 mRNA processing |
| • GO:0006396 RNA processing | • GO:0005634 nucleus |
| • GO:0005737 cytoplasm |
相关通路
• hsa03018 RNA degradation
• hsa03440 homologous recombination
蛋白质功能简介
PARN蛋白是一种多聚腺苷酸特异性核糖核酸酶,属于DEDD家族。它通过去除mRNA的poly(A)尾参与mRNA降解,调控基因表达。此外,PARN还参与端粒酶RNA组分(TERC)的3'端加工,影响端粒酶活性。PARN蛋白在细胞核和细胞质中均有分布,其功能异常与多种疾病相关。
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| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
|---|