PATZ1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

PATZ1是一种转录因子,参与基因表达调控、细胞分化与肿瘤发生,在多种癌症中发挥重要作用。

基因信息卡

基因符号 PATZ1
基因全名 POZ/BTB and AT hook containing zinc finger 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 22q12.1
NCBI Gene ID 23598 ncbi.nlm.nih.gov/gene/23598
Ensembl ID ENSG00000100100
UniProt ID Q9H6Z9
OMIM ID 605165
HGNC ID 16470
基因别名 ZNF278, MAZR, ZSG, dJ400N23

基因功能与研究简介

PATZ1(POZ/BTB and AT hook containing zinc finger 1)基因编码一种转录因子,属于BTB/POZ家族和锌指蛋白家族。PATZ1蛋白包含一个BTB/POZ结构域、一个AT钩基序和多个C2H2型锌指结构域,参与基因表达调控、染色质重塑和细胞分化。PATZ1在多种组织中表达,尤其在睾丸和脑中高表达。研究表明,PATZ1在肿瘤发生中具有双重作用,既可作为肿瘤抑制因子,也可作为癌基因,具体取决于细胞环境和相互作用蛋白。PATZ1的异常表达与多种癌症相关,包括结直肠癌、肺癌、乳腺癌和胶质瘤等。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
结直肠癌 PATZ1表达下调与肿瘤进展相关,可能通过调控Wnt信号通路影响细胞增殖和凋亡。 较强研究证据
肺癌 PATZ1在肺癌中表达异常,可能通过调控细胞周期和凋亡相关基因影响肿瘤生长。 较强研究证据
乳腺癌 PATZ1表达水平与乳腺癌预后相关,可能参与雌激素受体信号通路的调控。 较强研究证据
胶质瘤 PATZ1在胶质瘤中表达上调,可能促进肿瘤细胞侵袭和迁移。 潜在关联
前列腺癌 PATZ1可能通过调控雄激素受体信号通路影响前列腺癌进展。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
结肠 暂无可靠数据 中等表达
乳腺 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HCT116 暂无可靠数据 结直肠癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
U87 暂无可靠数据 胶质瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234C>T (p.Arg412Ter) 无义突变 罕见 可能导致截短蛋白,功能丧失
c.567_568insA (p.Gly190fs) 移码突变 罕见 可能导致截短蛋白,功能丧失
c.789G>A (p.Trp263Ter) 无义突变 罕见 可能导致截短蛋白,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

无义突变或移码突变导致蛋白截短,可能丧失转录调控功能,与肿瘤抑制功能丧失相关。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003677 (DNA binding) • GO:0005515 (protein binding)
• GO:0005634 (nucleus) • GO:0006355 (regulation of transcription
• DNA-templated) • GO:0045892 (negative regulation of transcription
• DNA-templated)

相关通路

Wnt signaling pathway (KEGG: hsa04310)
p53 signaling pathway (KEGG: hsa04115)

蛋白质功能简介

PATZ1蛋白是一种转录因子,包含BTB/POZ结构域、AT钩基序和锌指结构域。BTB/POZ结构域介导蛋白-蛋白相互作用和转录抑制,AT钩基序可能参与DNA结合,锌指结构域负责序列特异性DNA识别。PATZ1通过调控靶基因表达参与细胞分化、增殖和凋亡。在肿瘤中,PATZ1的表达异常可影响多种信号通路,如Wnt和p53通路,从而影响肿瘤发生发展。

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