PCBD2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

PCBD2编码pterin-4 alpha-carbinolamine dehydratase 2,参与四氢生物蝶呤代谢和转录调控,与苯丙酮尿症及癌症相关。

基因信息卡

基因符号 PCBD2
基因全名 pterin-4 alpha-carbinolamine dehydratase 2
基因类型 protein-coding
染色体位置 5q31.1
NCBI Gene ID 84105 ncbi.nlm.nih.gov/gene/84105
Ensembl ID ENSG00000132530
UniProt ID Q9H0N0
OMIM ID 609757
HGNC ID 29280
基因别名 DCOH2, PHS2, PCBD2

基因功能与研究简介

PCBD2基因编码pterin-4 alpha-carbinolamine dehydratase 2,该酶参与四氢生物蝶呤(BH4)的再生途径,催化pterin-4a-carbinolamine脱水为quinonoid dihydropterin。此外,PCBD2还作为转录共激活因子,与HNF1A等转录因子相互作用,调节基因表达。PCBD2的突变可能导致BH4缺乏,进而影响苯丙氨酸代谢,与高苯丙氨酸血症相关。近年研究还发现PCBD2在多种癌症中表达异常,可能参与肿瘤发生发展。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
高苯丙氨酸血症 PCBD2突变导致BH4缺乏,影响苯丙氨酸羟化酶活性,引起血苯丙氨酸升高。 ClinVar, OMIM
癌症 PCBD2在多种肿瘤中表达上调,可能通过调控转录和代谢促进肿瘤进展。 COSMIC, PubMed

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 胚胎肾细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1A>G (p.Met1Val) 错义突变 罕见 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失
c.2T>C (p.Met1Thr) 错义突变 罕见 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失
c.3G>A (p.Met1Ile) 错义突变 罕见 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

导致PCBD2酶活性降低或缺失,影响BH4再生,进而影响苯丙氨酸代谢。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003824 (catalytic activity) • GO:0008124 (4-alpha-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase activity)
• GO:0005634 (nucleus) • GO:0005737 (cytoplasm)
• GO:0006729 (tetrahydrobiopterin biosynthetic process) • GO:0006355 (regulation of transcription
• DNA-templated)

相关通路

hsa00790 (Folate biosynthesis)
hsa00410 (beta-Alanine metabolism)

蛋白质功能简介

PCBD2蛋白属于pterin-4 alpha-carbinolamine dehydratase家族,主要定位于细胞质和细胞核。在细胞质中,它催化BH4再生过程中的脱水反应;在细胞核中,它作为转录共激活因子,与HNF1A等转录因子结合,调节靶基因表达。PCBD2的晶体结构显示其形成同源四聚体,每个亚基含有一个锌离子结合位点。

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