PCDH18基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
PCDH18编码原钙粘蛋白18,参与神经发育和细胞黏附,与多种神经系统疾病和癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | PCDH18 |
|---|---|
| 基因全名 | Protocadherin 18 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 4q31.22 |
| NCBI Gene ID | 54560 ncbi.nlm.nih.gov/gene/54560 |
| Ensembl ID | ENSG00000163399 |
| UniProt ID | Q9HCL0 |
| OMIM ID | 608257 |
| HGNC ID | 8658 |
| 基因别名 | PCDH18L, KIAA1563 |
基因功能与研究简介
PCDH18基因编码原钙粘蛋白18,属于钙粘蛋白超家族,主要参与细胞黏附、神经发育和突触形成。该蛋白在脑组织中高表达,可能参与神经元迁移和突触可塑性。PCDH18的异常表达与多种神经系统疾病和癌症相关,但其具体机制仍在研究中。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 精神分裂症 | 潜在关联:PCDH18在脑组织中的表达异常可能影响神经发育和突触功能,与精神分裂症风险相关。 | 有研究证据,但尚未明确致病 |
| 自闭症谱系障碍 | 潜在关联:PCDH18参与突触形成和神经元连接,其变异可能增加自闭症风险。 | 有研究证据,但尚未明确致病 |
| 结直肠癌 | 癌症相关:PCDH18表达下调可能促进肿瘤侵袭和转移。 | 有研究证据,但尚未明确致病 |
| 肝细胞癌 | 癌症相关:PCDH18表达异常与肝癌的进展和预后相关。 | 有研究证据,但尚未明确致病 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234C>T (p.Arg412Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.4567A>G (p.Ile1523Val) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变,导致蛋白截短或降解,可能影响细胞黏附功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0007156 (homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
| • GO:0005509 (calcium ion binding) |
相关通路
• Cell adhesion molecules (CAMs) - Homo sapiens (human) (hsa04514)
蛋白质功能简介
PCDH18蛋白属于δ2-原钙粘蛋白家族,包含多个钙粘蛋白重复结构域和跨膜区,参与钙依赖性细胞黏附。在神经系统中,PCDH18可能调节神经元迁移和突触形成。其表达异常与肿瘤侵袭和转移相关,但具体分子机制尚待阐明。