PCDHA13基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
PCDHA13编码原钙粘蛋白α家族成员,参与神经发育和细胞黏附,与神经发育障碍和癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | PCDHA13 |
|---|---|
| 基因全名 | Protocadherin Alpha 13 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 5q31.3 |
| NCBI Gene ID | 56145 ncbi.nlm.nih.gov/gene/56145 |
| Ensembl ID | ENSG00000134853 |
| UniProt ID | Q9Y5H8 |
| OMIM ID | 606299 |
| HGNC ID | 8671 |
| 基因别名 | PCDH-ALPHA13 |
基因功能与研究简介
PCDHA13基因编码原钙粘蛋白α家族成员,属于钙粘蛋白超家族。该蛋白是细胞黏附分子,在神经系统中高表达,参与神经元连接和突触形成。PCDHA13基因的变异可能与神经发育障碍和某些癌症相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 神经发育障碍 | PCDHA13基因变异可能影响神经元黏附,导致神经发育异常,但具体机制尚不明确。 | 暂无明确证据 |
| 癌症 | PCDHA13在多种肿瘤中表达异常,可能参与肿瘤侵袭和转移,但具体作用需进一步研究。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.Thr412Ala) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,功能影响未知 |
| c.567delC (p.Leu189fs) | 移码突变 | 罕见 | 可能导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变,如移码突变导致蛋白截短,可能影响细胞黏附功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0007156 (homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
| • GO:0005509 (calcium ion binding) |
相关通路
• Cell adhesion molecules (CAMs) - Homo sapiens (human) (WP2857)
蛋白质功能简介
PCDHA13蛋白属于原钙粘蛋白α家族,包含多个钙粘蛋白重复结构域,参与钙依赖性细胞黏附。在神经系统中,PCDHA13可能通过同嗜性相互作用调节神经元连接。其表达异常可能与肿瘤进展相关。