PCDHA2基因|基因功能、疾病关联、突变与表达图谱
PCDHA2编码原钙粘蛋白α家族成员,参与神经发育和细胞黏附,与神经发育障碍和癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | PCDHA2 |
|---|---|
| 基因全名 | Protocadherin Alpha 2 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 5q31.3 |
| NCBI Gene ID | 56145 ncbi.nlm.nih.gov/gene/56145 |
| Ensembl ID | ENSG00000164171 |
| UniProt ID | Q9Y5I2 |
| OMIM ID | 604127 |
| HGNC ID | 8668 |
| 基因别名 | PCDH-ALPHA2 |
基因功能与研究简介
PCDHA2基因编码原钙粘蛋白α家族的一员,属于钙粘蛋白超家族。该蛋白是细胞膜上的黏附分子,主要参与神经系统的发育和突触形成。PCDHA2在脑组织中高表达,尤其在胎儿和成人脑的特定区域。研究表明,PCDHA2可能参与神经元连接的特异性建立,并与某些神经发育障碍和癌症相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 神经发育障碍 | PCDHA2基因突变可能影响神经元黏附和突触形成,导致神经发育异常。 | 暂无明确证据,但基于功能推测 |
| 癌症 | PCDHA2表达异常可能影响细胞黏附,促进肿瘤侵袭和转移。 | 部分研究提示潜在关联,但证据有限 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123C>T (p.Arg41Cys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,导致功能异常 |
| c.456delA (p.Lys152fs) | 移码突变 | 罕见 | 可能导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失突变,如移码突变导致蛋白截短,可能影响细胞黏附功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0007156 (homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
| • GO:0007155 (cell adhesion) |
相关通路
• Cell adhesion molecules (CAMs) - Homo sapiens (human) (WP1790)
• Neuronal System (WP2841)
蛋白质功能简介
PCDHA2蛋白是原钙粘蛋白α家族成员,属于I型跨膜蛋白。其胞外域含有多个钙粘蛋白重复序列,介导钙依赖性同嗜性细胞黏附。胞内域与细胞骨架相互作用,参与信号转导。PCDHA2在神经系统中高表达,对神经元连接的特异性建立至关重要。