PCDHA4基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究

PCDHA4编码原钙粘蛋白α家族成员,参与神经发育和细胞黏附,与神经发育障碍及癌症相关。

基因信息卡

基因符号 PCDHA4
基因全名 Protocadherin Alpha 4
基因类型 protein-coding
染色体位置 5q31.3
NCBI Gene ID 56143 ncbi.nlm.nih.gov/gene/56143
Ensembl ID ENSG00000134853
UniProt ID Q9Y5H8
OMIM ID 606314
HGNC ID 8668
基因别名 PCDH-ALPHA4

基因功能与研究简介

PCDHA4(原钙粘蛋白α4)属于原钙粘蛋白α基因簇,该基因簇位于染色体5q31.3,包含多个可变外显子,编码不同的α原钙粘蛋白。PCDHA4蛋白是钙依赖性细胞黏附分子,主要在神经系统中表达,参与神经元的连接和突触形成。研究表明PCDHA4在神经发育中起重要作用,其异常表达与神经发育障碍和某些癌症相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经发育障碍 PCDHA4参与神经元黏附和突触形成,其突变或表达异常可能影响神经发育,但具体机制尚不明确。 暂无明确证据
癌症 PCDHA4在多种癌症中表达异常,可能通过影响细胞黏附参与肿瘤进展,但具体作用需进一步研究。 具有较强研究证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 低表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123A>G (p.Ile41Met) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白功能,但需进一步验证
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变,导致蛋白功能丧失或减弱,可能影响细胞黏附。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变,导致蛋白获得新功能或活性增强,可能促进肿瘤发生。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变,突变蛋白干扰正常蛋白功能,可能影响细胞信号传导。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0007156 (homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules) • GO:0005886 (plasma membrane)
• GO:0005509 (calcium ion binding)

相关通路

Cell adhesion molecules (CAMs) - Homo sapiens (human) (WP566)

蛋白质功能简介

PCDHA4蛋白是原钙粘蛋白α家族成员,属于钙依赖性细胞黏附分子。蛋白包含胞外钙黏蛋白重复结构域、跨膜区和胞内尾区。主要在神经系统中表达,参与神经元黏附、突触形成和神经回路构建。其表达异常与神经发育障碍和癌症相关。

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