PCDHAC2基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究

PCDHAC2编码原钙粘蛋白AC2,参与神经发育和细胞黏附,与神经精神疾病和癌症相关。

基因信息卡

基因符号 PCDHAC2
基因全名 Protocadherin alpha subfamily C, 2
基因类型 protein-coding
染色体位置 5q31.3
NCBI Gene ID 56134 ncbi.nlm.nih.gov/gene/56134
Ensembl ID ENSG00000181036
UniProt ID Q9Y5I3
OMIM ID 暂无可靠数据
HGNC ID 14267
基因别名 PCDH-alpha-C2

基因功能与研究简介

PCDHAC2(原钙粘蛋白α亚家族C成员2)属于原钙粘蛋白基因簇,位于人类染色体5q31.3。该基因编码的蛋白质是钙粘蛋白超家族成员,参与神经元的黏附、突触形成和神经回路构建。PCDHAC2在脑组织中高表达,尤其在发育中的大脑中,可能参与神经精神疾病的病理过程。此外,PCDHAC2的异常表达与某些癌症相关,但具体机制尚待研究。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
精神分裂症 潜在关联:PCDHAC2基因变异可能影响神经发育,增加精神分裂症风险。 暂无明确证据
自闭症谱系障碍 潜在关联:原钙粘蛋白家族与自闭症相关,但PCDHAC2具体证据不足。 暂无明确证据
结直肠癌 潜在关联:PCDHAC2表达异常可能影响肿瘤细胞黏附,但研究有限。 暂无明确证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达(基于RNA测序)
睾丸 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
HEK293 暂无可靠数据 胚胎肾细胞系
HCT116 暂无可靠数据 结直肠癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
rs143877920 SNV 0.1% 错义突变,可能影响蛋白功能
rs147787990 SNV 0.05% 同义突变,功能影响未知
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

暂无明确证据

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0007156 (homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules) • GO:0005886 (plasma membrane)
• GO:0005509 (calcium ion binding)

相关通路

暂无明确Pathway ID

蛋白质功能简介

PCDHAC2蛋白属于原钙粘蛋白家族,具有钙离子结合域和跨膜结构域,参与细胞间黏附。在神经系统中,PCDHAC2可能通过同嗜性相互作用调节突触连接。其具体功能尚需进一步研究。

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