PCDHB4基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

PCDHB4编码原钙粘蛋白β家族成员,参与神经发育和细胞黏附,与神经精神疾病和癌症相关。

基因信息卡

基因符号 PCDHB4
基因全名 Protocadherin beta 4
基因类型 protein-coding
染色体位置 5q31.3
NCBI Gene ID 56131 ncbi.nlm.nih.gov/gene/56131
Ensembl ID ENSG00000182054
UniProt ID Q9Y5E8
OMIM ID 606330
HGNC ID 8680
基因别名 PCDH-BETA4

基因功能与研究简介

PCDHB4基因编码原钙粘蛋白β家族成员,属于钙粘蛋白超家族。该蛋白是细胞膜上的钙依赖性黏附分子,在神经系统中高表达,参与神经元的连接和突触形成。PCDHB4基因位于5q31.3的基因簇中,该区域与多种神经精神疾病相关。研究表明PCDHB4可能参与细胞信号传导和细胞识别,其异常表达与某些癌症和神经发育障碍有关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
自闭症谱系障碍 潜在关联:PCDHB4在神经发育中发挥作用,基因变异可能影响突触连接,但证据尚不充分。 暂无明确证据
精神分裂症 潜在关联:基因位于5q31.3风险区域,但具体机制未明。 暂无明确证据
结直肠癌 癌症相关:PCDHB4表达异常可能影响细胞黏附,促进肿瘤进展。 研究证据有限
乳腺癌 癌症相关:PCDHB4甲基化可能影响表达,与肿瘤发生相关。 研究证据有限

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达(根据UniProt)
睾丸 暂无可靠数据 中等表达(根据UniProt)
暂无可靠数据 低表达(根据UniProt)
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
rs11190870 SNV 未知 可能影响剪接,但功能影响未明
c.1234C>T (p.Arg412Ter) 无义突变 罕见 可能导致截短蛋白,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变:导致蛋白功能缺失或减弱,可能影响细胞黏附。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变:目前暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变:目前暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0007156 (homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules) • GO:0005886 (plasma membrane)
• GO:0005509 (calcium ion binding)

相关通路

Cell adhesion molecules (CAMs) - Homo sapiens (human) (KEGG: hsa04514)

蛋白质功能简介

PCDHB4蛋白属于原钙粘蛋白β家族,是钙粘蛋白超家族的成员。该蛋白包含胞外钙粘蛋白重复结构域、跨膜区和胞内尾区,参与钙依赖性细胞黏附。在神经系统中,PCDHB4可能参与神经元连接和突触形成。其表达调控异常与癌症和神经发育障碍相关。

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