PCDHB5基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究

PCDHB5编码原钙粘蛋白β家族成员,参与神经发育和细胞黏附,与神经发育障碍和癌症相关。

基因信息卡

基因符号 PCDHB5
基因全名 Protocadherin Beta 5
基因类型 protein-coding
染色体位置 5q31.3
NCBI Gene ID 56178 ncbi.nlm.nih.gov/gene/56178
Ensembl ID ENSG00000112902
UniProt ID Q9Y5E6
OMIM ID 606313
HGNC ID 8670
基因别名 PCDH-BETA5

基因功能与研究简介

PCDHB5(原钙粘蛋白β5)属于原钙粘蛋白β基因簇,位于染色体5q31.3。该基因编码的蛋白质是钙依赖性细胞黏附分子,主要在神经系统中表达,参与神经元的连接和突触形成。PCDHB5在神经发育中发挥重要作用,其异常表达或突变可能与神经发育障碍和某些癌症相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
自闭症谱系障碍 PCDHB5基因变异可能影响神经元黏附,导致突触形成异常,与自闭症谱系障碍相关。 有研究证据,但尚未明确致病
精神分裂症 PCDHB5表达异常可能影响神经环路,与精神分裂症风险相关。 有研究证据,但尚未明确致病
结直肠癌 PCDHB5在结直肠癌中表达下调,可能通过影响细胞黏附促进肿瘤进展。 有研究证据,但尚未明确致病
乳腺癌 PCDHB5在乳腺癌中表达异常,可能参与肿瘤转移。 有研究证据,但尚未明确致病

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
HCT116 暂无可靠数据 结直肠癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
rs143171067 SNV 0.01% 错义突变,可能影响蛋白功能
rs201430590 SNV 0.005% 错义突变,可能影响蛋白功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变可能导致PCDHB5蛋白表达减少或功能丧失,影响细胞黏附,与神经发育障碍相关。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变可能增强PCDHB5的黏附功能,促进肿瘤细胞迁移,但证据有限。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变可能干扰正常PCDHB5蛋白的功能,但尚无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0007156 (homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules) • GO:0005509 (calcium ion binding)
• GO:0005886 (plasma membrane) • GO:0007155 (cell adhesion)

相关通路

Cell adhesion molecules (CAMs) - Homo sapiens (human) (hsa04514)
Axon guidance (hsa04360)

蛋白质功能简介

PCDHB5蛋白是原钙粘蛋白家族成员,属于钙依赖性细胞黏附分子。该蛋白包含胞外钙黏蛋白重复结构域、跨膜区和胞内尾区,参与同嗜性细胞黏附,在神经发育中调节神经元连接和突触形成。PCDHB5在脑组织中高表达,其异常表达与神经发育障碍和癌症相关。

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