PCDHGA5基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究

PCDHGA5(原钙粘蛋白γ亚家族A5)是钙粘蛋白超家族成员,参与神经发育和细胞黏附,其表达异常与多种癌症相关。

基因信息卡

基因符号 PCDHGA5
基因全名 Protocadherin Gamma Subfamily A, 5
基因类型 protein-coding
染色体位置 5q31.3
NCBI Gene ID 56143 ncbi.nlm.nih.gov/gene/56143
Ensembl ID ENSG00000113520
UniProt ID Q9Y5H6
OMIM ID 606309
HGNC ID 8698
基因别名 PCDH-GAMMA-A5

基因功能与研究简介

PCDHGA5(原钙粘蛋白γ亚家族A5)是钙粘蛋白超家族的一员,属于原钙粘蛋白γ簇。该基因编码的蛋白质是细胞膜上的钙依赖性黏附分子,在神经系统中高表达,参与神经元的发育、突触形成和细胞间识别。PCDHGA5基因的异常表达与多种癌症(如结直肠癌、乳腺癌)的发生发展相关,可能通过影响细胞黏附、增殖和凋亡等过程发挥作用。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
结直肠癌 PCDHGA5在结直肠癌中表达下调,可能通过影响细胞黏附促进肿瘤侵袭和转移。 较强研究证据
乳腺癌 PCDHGA5在乳腺癌中表达异常,与肿瘤分级和预后相关。 潜在关联
神经发育障碍 PCDHGA5参与神经发育,其突变可能与神经发育异常相关,但具体机制尚不明确。 暂无明确证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 低表达
暂无可靠数据 低表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HCT116 暂无可靠数据 结直肠癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234C>T (p.Arg412Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.567A>G (p.Ile189Val) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能缺失型突变):导致蛋白质功能丧失或减弱,如无义突变、移码突变等。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得型突变):导致蛋白质获得新的或增强的功能,如某些错义突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性突变):突变蛋白干扰正常蛋白的功能,如形成无功能的二聚体。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0007156 (homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules) • GO:0005886 (plasma membrane)
• GO:0005509 (calcium ion binding)

相关通路

Cell adhesion molecules (CAMs) - Homo sapiens (human) (KEGG: hsa04514)

蛋白质功能简介

PCDHGA5蛋白属于原钙粘蛋白γ亚家族,是细胞膜上的钙依赖性黏附分子。该蛋白包含多个钙粘蛋白重复结构域,参与细胞间黏附、信号转导和神经发育。在神经系统中,PCDHGA5可能参与突触形成和神经元网络构建。在肿瘤中,PCDHGA5的表达异常可能影响肿瘤细胞的侵袭和转移能力。

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