PCDHGB5基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

PCDHGB5编码原钙粘蛋白γ亚家族B成员5,参与神经发育和细胞黏附,与神经发育障碍和癌症相关。

基因信息卡

基因符号 PCDHGB5
基因全名 Protocadherin gamma subfamily B, 5
基因类型 protein-coding
染色体位置 5q31.3
NCBI Gene ID 56102 ncbi.nlm.nih.gov/gene/56102
Ensembl ID ENSG00000113272
UniProt ID Q9Y5F3
OMIM ID 606314
HGNC ID 8708
基因别名 PCDH-GAMMA-B5

基因功能与研究简介

PCDHGB5(原钙粘蛋白γ亚家族B成员5)属于原钙粘蛋白γ基因簇,该基因簇包含22个串联排列的基因,分为A、B、C三个亚家族。PCDHGB5编码的蛋白质是钙依赖性细胞黏附分子,主要表达于神经系统,参与神经元的发育、突触形成和神经回路构建。该基因的异常表达或突变可能与神经发育障碍和某些癌症相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经发育障碍 PCDHGB5突变可能影响神经元黏附和迁移,导致神经发育异常,但具体机制尚不明确。 暂无明确证据
癌症 PCDHGB5在多种肿瘤中表达异常,可能通过影响细胞黏附参与肿瘤侵袭和转移,但具体作用需进一步研究。 具有较强研究证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 低表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
HEK293 暂无可靠数据 胚胎肾细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234C>T (p.Arg412Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.4567A>G (p.Ile1523Val) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能缺失):无义突变导致截短蛋白,可能丧失细胞黏附功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明PCDHGB5存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性):目前暂无明确证据表明PCDHGB5存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0007156 (homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules) • GO:0005886 (plasma membrane)
• GO:0005509 (calcium ion binding)

相关通路

Cell adhesion molecules (CAMs) - Homo sapiens (human) (WP660)
Neuronal System (WP3937)

蛋白质功能简介

PCDHGB5蛋白属于原钙粘蛋白家族,包含多个钙黏蛋白结构域,参与钙依赖性细胞黏附。该蛋白在神经系统中高表达,可能参与神经元识别和突触形成。其胞内域含有保守的细胞质信号基序,可能参与信号转导。

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