PCDHGC5基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究

PCDHGC5编码原钙粘蛋白γ亚家族C5成员,参与神经发育和细胞黏附,与神经发育障碍及癌症相关。

基因信息卡

基因符号 PCDHGC5
基因全名 Protocadherin gamma subfamily C, 5
基因类型 protein-coding
染色体位置 5q31.3
NCBI Gene ID 5095 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5095
Ensembl ID ENSG00000113520
UniProt ID Q9Y5F3
OMIM ID 606299
HGNC ID 8712
基因别名 PCDH-GAMMA-C5

基因功能与研究简介

PCDHGC5(原钙粘蛋白γ亚家族C5)属于原钙粘蛋白γ基因簇,该基因簇包含22个串联排列的基因,主要表达于神经系统。PCDHGC5编码的蛋白质是钙依赖性细胞黏附分子,参与神经元的突触形成、神经回路建立及细胞间通讯。研究表明,PCDHGC5在神经发育中发挥重要作用,其异常表达与神经发育障碍及某些癌症相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经发育障碍 PCDHGC5基因突变可能影响神经元黏附和突触形成,导致神经发育异常,但具体机制尚不明确。 暂无明确证据,基于基因功能推测
癌症 PCDHGC5在多种肿瘤中表达异常,可能通过影响细胞黏附参与肿瘤侵袭和转移。 有研究报道,但证据有限

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达(基于RNA测序)
暂无可靠数据 低表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Thr412Ala) 错义突变 未知 可能影响蛋白结构,功能影响未知
c.567delC (p.Leu189fs) 移码突变 未知 可能导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变(Loss of Function):如移码突变导致蛋白截短,可能使蛋白失去正常黏附功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变(Gain of Function):目前暂无明确证据表明PCDHGC5存在此类突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变(Dominant Negative):目前暂无明确证据表明PCDHGC5存在此类突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0007156 (homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules) • GO:0005886 (plasma membrane)
• GO:0005509 (calcium ion binding)

相关通路

Cell adhesion molecules (CAMs) - Homo sapiens (human) (hsa04514)

蛋白质功能简介

PCDHGC5蛋白属于原钙粘蛋白家族,包含钙黏蛋白结构域和跨膜区,参与钙依赖性细胞黏附。主要在神经系统中表达,参与神经元突触形成和神经回路构建。蛋白结构异常可能影响细胞间相互作用,与神经发育和肿瘤进展相关。

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