PCF11基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

PCF11是mRNA 3'末端加工的关键因子,参与转录终止和多聚腺苷酸化,其功能异常与神经发育疾病和癌症相关。

基因信息卡

基因符号 PCF11
基因全名 PCF11 cleavage and polyadenylation factor subunit
基因类型 protein-coding
染色体位置 11q12.2
NCBI Gene ID 51585 ncbi.nlm.nih.gov/gene/51585
Ensembl ID ENSG00000165494
UniProt ID O94913
OMIM ID 618889
HGNC ID 25617
基因别名 F11, KIAA0824, dJ259I14.1

基因功能与研究简介

PCF11基因编码mRNA 3'末端加工复合体的一个亚基,参与前体mRNA的切割和多聚腺苷酸化,以及转录终止。PCF11在调控基因表达中发挥重要作用,其功能异常与神经发育障碍和某些癌症相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经发育障碍 PCF11突变可能导致mRNA加工异常,影响神经发育相关基因的表达,与智力障碍和自闭症谱系障碍相关。 ClinVar, OMIM
癌症 PCF11在多种肿瘤中表达异常,可能通过影响癌基因或抑癌基因的mRNA加工参与肿瘤发生。 COSMIC, PubMed

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Lys412Glu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.2345delC (p.Pro782LeufsTer3) 移码突变 罕见 导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

导致PCF11蛋白功能丧失或减弱,可能影响mRNA加工,与神经发育障碍相关。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0005634 nucleus
• GO:0006378 mRNA polyadenylation • GO:0006397 mRNA processing
• GO:0031124 mRNA 3'-end processing

相关通路

mRNA 3'-end processing (Reactome: R-HSA-72163)
Cleavage of Growing Transcript in the Termination Region (Reactome: R-HSA-72172)

蛋白质功能简介

PCF11蛋白是mRNA切割和聚腺苷酸化特异性因子复合体的一个亚基,参与前体mRNA的3'末端加工。该蛋白含有CID(CTD-interacting domain)结构域,能够与RNA聚合酶II的C端结构域相互作用,从而在转录终止中发挥作用。PCF11还参与mRNA的核输出和翻译调控。

相关产品

产品名称 货号 物种 基因 ID
联系我们
*
*
*
来源:
service online

  • 留言
  • You can send email to contact us.
    邮箱
  • You can send email to contact us.
    电话
    联系电话
    中国总部
    18102225074(微信同号)

  •  回到顶部