PCF11基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
PCF11是mRNA 3'末端加工的关键因子,参与转录终止和多聚腺苷酸化,其功能异常与神经发育疾病和癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | PCF11 |
|---|---|
| 基因全名 | PCF11 cleavage and polyadenylation factor subunit |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 11q12.2 |
| NCBI Gene ID | 51585 ncbi.nlm.nih.gov/gene/51585 |
| Ensembl ID | ENSG00000165494 |
| UniProt ID | O94913 |
| OMIM ID | 618889 |
| HGNC ID | 25617 |
| 基因别名 | F11, KIAA0824, dJ259I14.1 |
基因功能与研究简介
PCF11基因编码mRNA 3'末端加工复合体的一个亚基,参与前体mRNA的切割和多聚腺苷酸化,以及转录终止。PCF11在调控基因表达中发挥重要作用,其功能异常与神经发育障碍和某些癌症相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 神经发育障碍 | PCF11突变可能导致mRNA加工异常,影响神经发育相关基因的表达,与智力障碍和自闭症谱系障碍相关。 | ClinVar, OMIM |
| 癌症 | PCF11在多种肿瘤中表达异常,可能通过影响癌基因或抑癌基因的mRNA加工参与肿瘤发生。 | COSMIC, PubMed |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.Lys412Glu) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| c.2345delC (p.Pro782LeufsTer3) | 移码突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
导致PCF11蛋白功能丧失或减弱,可能影响mRNA加工,与神经发育障碍相关。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0005634 nucleus |
| • GO:0006378 mRNA polyadenylation | • GO:0006397 mRNA processing |
| • GO:0031124 mRNA 3'-end processing |
相关通路
• mRNA 3'-end processing (Reactome: R-HSA-72163)
• Cleavage of Growing Transcript in the Termination Region (Reactome: R-HSA-72172)
蛋白质功能简介
PCF11蛋白是mRNA切割和聚腺苷酸化特异性因子复合体的一个亚基,参与前体mRNA的3'末端加工。该蛋白含有CID(CTD-interacting domain)结构域,能够与RNA聚合酶II的C端结构域相互作用,从而在转录终止中发挥作用。PCF11还参与mRNA的核输出和翻译调控。
相关产品
| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
|---|