PCGF6基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

PCGF6是Polycomb抑制复合物1(PRC1)的核心组分,参与基因转录调控、细胞分化与肿瘤发生,是表观遗传学研究的重要靶点。

基因信息卡

基因符号 PCGF6
基因全名 polycomb group ring finger 6
基因类型 protein-coding
染色体位置 10q26.3
NCBI Gene ID 84108 ncbi.nlm.nih.gov/gene/84108
Ensembl ID ENSG00000120063
UniProt ID Q9BYE7
OMIM ID 608512
HGNC ID 19155
基因别名 RNF134; C10orf125; MGC131839

基因功能与研究简介

PCGF6(polycomb group ring finger 6)是Polycomb抑制复合物1(PRC1)的核心组分,具有E3泛素连接酶活性,通过催化组蛋白H2A单泛素化(H2AK119ub1)参与基因转录抑制。PCGF6在胚胎干细胞中调控多能性相关基因的表达,并在细胞分化、增殖和凋亡中发挥重要作用。研究表明,PCGF6在多种肿瘤中异常表达,与肿瘤的发生发展密切相关。此外,PCGF6还参与DNA损伤修复和基因组稳定性维持。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 PCGF6在多种癌症中表达异常,可能通过调控细胞增殖、凋亡和分化参与肿瘤发生。 较强研究证据
神经发育障碍 PCGF6可能参与神经发育相关基因的调控,但具体关联尚不明确。 潜在关联
免疫系统疾病 PCGF6在免疫细胞中的表达可能影响免疫应答,但证据有限。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
H1人胚胎干细胞 暂无可靠数据 高表达
HeLa 暂无可靠数据 中等表达
HEK293 暂无可靠数据 中等表达
MCF7 暂无可靠数据 低表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123C>T (p.Arg41Cys) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但具体影响未知
c.456delA (p.Lys152fs) 移码突变 罕见 可能导致蛋白截短,功能丧失
c.789G>A (p.Trp263Ter) 无义突变 罕见 导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,如移码突变或无义突变,导致蛋白截短或降解,影响PRC1复合物功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变,目前暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变,可能干扰正常PCGF6蛋白功能,但暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0008270 zinc ion binding
• GO:0004842 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0006325 chromatin organization
• GO:0006355 regulation of transcription • DNA-templated
• GO:0005634 nucleus

相关通路

hsa04136 Autophagy - other
hsa04144 Endocytosis
hsa04310 Wnt signaling pathway
hsa04390 Hippo signaling pathway

蛋白质功能简介

PCGF6蛋白由341个氨基酸组成,包含一个RING finger结构域,具有E3泛素连接酶活性。作为PRC1复合物的核心组分,PCGF6通过催化组蛋白H2A单泛素化(H2AK119ub1)参与基因转录抑制。PCGF6在胚胎干细胞中调控多能性相关基因的表达,并在细胞分化、增殖和凋亡中发挥重要作用。研究表明,PCGF6在多种肿瘤中异常表达,与肿瘤的发生发展密切相关。此外,PCGF6还参与DNA损伤修复和基因组稳定性维持。

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