PDCD11基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

PDCD11编码一种参与核糖体生物发生和细胞凋亡调控的蛋白质,其异常表达与多种癌症相关。

基因信息卡

基因符号 PDCD11
基因全名 programmed cell death 11
基因类型 protein-coding
染色体位置 10q25.2
NCBI Gene ID 22984 ncbi.nlm.nih.gov/gene/22984
Ensembl ID ENSG00000148848
UniProt ID Q14690
OMIM ID 608850
HGNC ID 16973
基因别名 ALG-4, FLJ10851, KIAA0118, MGC117215

基因功能与研究简介

PDCD11(programmed cell death 11)基因编码一种核仁蛋白,参与核糖体RNA的加工和核糖体生物发生。该蛋白还参与细胞凋亡的调控,可能通过影响p53信号通路发挥作用。PDCD11在多种肿瘤中表达异常,与肿瘤的发生发展相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
结直肠癌 PDCD11在结直肠癌组织中表达上调,可能通过促进细胞增殖和抑制凋亡参与肿瘤发生。 较强研究证据
肝细胞癌 PDCD11在肝细胞癌中高表达,与不良预后相关,可能通过调控细胞周期和凋亡影响肿瘤进展。 较强研究证据
乳腺癌 PDCD11在乳腺癌中表达异常,可能参与肿瘤转移和耐药。 潜在关联
肺癌 PDCD11在非小细胞肺癌中表达上调,可能作为预后标志物。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
骨髓 暂无可靠数据 暂无可靠数据
淋巴结 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Thr412Ala) SNV 0.01% 暂无明确功能影响
c.2345C>T (p.Arg782Trp) SNV 0.005% 可能影响蛋白结构
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

暂无明确证据表明PDCD11突变导致功能缺失。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明PDCD11突变导致功能获得。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明PDCD11突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005730 nucleolus • GO:0006364 rRNA processing
• GO:0006915 apoptotic process • GO:0005634 nucleus

相关通路

Ribosome biogenesis (Reactome: R-HSA-6791226)
Apoptosis (KEGG: hsa04210)

蛋白质功能简介

PDCD11蛋白是一种核仁蛋白,参与核糖体RNA的加工和核糖体生物发生。它可能通过调节p53信号通路参与细胞凋亡的调控。PDCD11在多种肿瘤中表达异常,可能作为潜在的肿瘤标志物和治疗靶点。

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