PDE6B基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

PDE6B编码视网膜cGMP磷酸二酯酶β亚基,是视网膜信号传导的关键酶,其突变导致视网膜色素变性和先天性黑蒙症。

基因信息卡

基因符号 PDE6B
基因全名 Phosphodiesterase 6B
基因类型 protein-coding
染色体位置 4p16.3
NCBI Gene ID 5158 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5158
Ensembl ID ENSG00000133256
UniProt ID P35913
OMIM ID 180072
HGNC ID 8786
基因别名 RP40, CSNB2, PDEB, cGMP-PDE beta

基因功能与研究简介

PDE6B基因编码视网膜cGMP磷酸二酯酶(PDE6)的β亚基。PDE6是光感受器细胞中参与光信号转导的关键酶,负责水解cGMP,调节离子通道的开放状态。PDE6B基因突变可导致视网膜色素变性(RP)和先天性黑蒙症(LCA),这些疾病以进行性视力丧失为特征。PDE6B在视网膜中特异性高表达,其功能异常直接影响光感受器的存活和功能。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
视网膜色素变性 PDE6B基因突变导致PDE6酶活性降低或丧失,使cGMP水平升高,导致光感受器细胞死亡,引起进行性视网膜变性。 已明确致病
先天性黑蒙症 PDE6B基因突变可导致严重的先天性视网膜病变,表现为出生时或婴儿期即出现严重的视力障碍。 已明确致病
常染色体隐性遗传视网膜色素变性 PDE6B基因的隐性突变是RP的常见原因之一,患者通常表现为夜盲和视野缩小。 已明确致病

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
视网膜 暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 低表达
其他组织 暂无可靠数据 极低或未检测到
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
Y79视网膜母细胞瘤细胞系 暂无可靠数据 表达
ARPE-19视网膜色素上皮细胞系 暂无可靠数据 低表达
其他细胞系 暂无可靠数据 未检测到
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.998G>A (p.Arg333Gln) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.1929delC (p.Ile644SerfsTer2) 移码突变 罕见 导致蛋白截短,功能丧失
c.2197C>T (p.Arg733Ter) 无义突变 罕见 导致蛋白截短,功能丧失
c.1A>G (p.Met1Val) 起始密码子突变 罕见 可能影响翻译起始,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

大多数PDE6B突变导致蛋白功能丧失或降低,包括无义突变、移码突变和剪接位点突变,这些突变导致PDE6酶活性降低或缺失,使cGMP水平升高,最终导致光感受器细胞死亡。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明PDE6B存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

PDE6B突变通常以隐性方式遗传,但某些错义突变可能产生显性负效应,干扰野生型蛋白的功能,但具体机制尚需进一步研究。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0004114 (3' • 5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity)
• GO:0007602 (phototransduction) • GO:0005886 (plasma membrane)
• GO:0001750 (photoreceptor outer segment)

相关通路

Phototransduction (KEGG: hsa04744)
cGMP-PKG signaling pathway (KEGG: hsa04022)

蛋白质功能简介

PDE6B蛋白是视网膜cGMP磷酸二酯酶(PDE6)的β亚基,与α和γ亚基组成异源四聚体。PDE6在光感受器细胞中催化cGMP水解,调节cGMP门控阳离子通道的开放,是光信号转导的关键步骤。PDE6B蛋白包含催化结构域和调节结构域,其活性受G蛋白(转导素)和cGMP的调控。PDE6B基因突变导致PDE6活性异常,引起cGMP积累,导致光感受器细胞凋亡,是视网膜色素变性和先天性黑蒙症的常见病因。

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