PDGFD基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

PDGFD编码血小板衍生生长因子D,参与血管生成、组织重塑和纤维化,与多种癌症及纤维化疾病相关。

基因信息卡

基因符号 PDGFD
基因全名 platelet derived growth factor D
基因类型 protein-coding
染色体位置 11q22.3
NCBI Gene ID 80310 ncbi.nlm.nih.gov/gene/80310
Ensembl ID ENSG00000170962
UniProt ID Q9GZP0
OMIM ID 609673
HGNC ID 30620
基因别名 IEGF, SCDGF-D, SCDGFD

基因功能与研究简介

PDGFD基因编码血小板衍生生长因子D(PDGF-D),属于PDGF/VEGF生长因子家族。PDGF-D以潜伏形式合成,需经蛋白水解激活后与PDGFR-β受体结合,激活下游信号通路,参与调控细胞增殖、迁移、血管生成和组织重塑。PDGFD在多种组织中表达,尤其在胎盘、心脏和胰腺中高表达。研究表明,PDGFD在多种癌症中过表达,与肿瘤进展和不良预后相关,同时在纤维化疾病中发挥重要作用。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症(多种类型) PDGFD过表达促进肿瘤血管生成和细胞增殖,与肿瘤进展和不良预后相关。 较强研究证据
特发性肺纤维化 PDGFD通过激活PDGFR-β促进成纤维细胞增殖和胶原沉积,参与肺纤维化进程。 较强研究证据
肝纤维化 PDGFD在肝星状细胞中表达上调,促进肝纤维化发展。 研究证据
动脉粥样硬化 PDGFD参与血管平滑肌细胞增殖和迁移,与动脉粥样硬化斑块形成相关。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
胎盘 暂无可靠数据 高表达
心脏 暂无可靠数据 高表达
胰腺 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
肝脏 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HUVEC 暂无可靠数据 内皮细胞
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234G>A (p.Val412Met) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但临床意义未明
c.456delC (p.Pro152LeufsTer5) 移码突变 罕见 导致蛋白截短,可能丧失功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

导致PDGF-D蛋白功能丧失或减少,可能影响血管生成和组织修复。

Gain of Function(功能获得,GOF)

增强PDGF-D活性,可能促进肿瘤生长和纤维化。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

突变蛋白干扰正常PDGF-D功能,但证据不足。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005161 (platelet-derived growth factor receptor binding) • GO:0008083 (growth factor activity)
• GO:0005615 (extracellular space) • GO:0048018 (receptor tyrosine kinase signaling pathway)

相关通路

hsa04151 (PI3K-Akt signaling pathway)
hsa05200 (Pathways in cancer)
hsa04510 (Focal adhesion)

蛋白质功能简介

PDGF-D蛋白是血小板衍生生长因子家族成员,由PDGFD基因编码。该蛋白以潜伏形式合成,需经蛋白水解去除N端结构域后激活,释放生长因子结构域。激活的PDGF-D与PDGFR-β受体结合,激活下游信号通路,如PI3K-Akt和MAPK通路,调控细胞增殖、迁移和存活。PDGF-D在多种组织中表达,参与血管生成、组织重塑和纤维化过程。在多种癌症中,PDGFD过表达与肿瘤进展和不良预后相关,使其成为潜在的药物靶点。

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