PDGFRL基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
PDGFRL基因编码血小板衍生生长因子受体样蛋白,参与细胞增殖调控,与多种癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | PDGFRL |
|---|---|
| 基因全名 | platelet derived growth factor receptor like |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 8p21.3 |
| NCBI Gene ID | 5157 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5157 |
| Ensembl ID | ENSG00000104447 |
| UniProt ID | Q15198 |
| OMIM ID | 604584 |
| HGNC ID | 8803 |
| 基因别名 | PDGRL |
基因功能与研究简介
PDGFRL基因编码血小板衍生生长因子受体样蛋白,该蛋白与血小板衍生生长因子受体β(PDGFRB)具有高度同源性,但缺乏酪氨酸激酶活性。PDGFRL蛋白可能作为PDGFRB的负调控因子,通过竞争性结合PDGF配体或形成无活性异源二聚体来抑制PDGF信号通路,从而调控细胞增殖和分化。研究表明,PDGFRL在多种肿瘤中表达下调或缺失,提示其可能作为肿瘤抑制基因发挥作用。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 结直肠癌 | PDGFRL表达下调或缺失,可能通过解除对PDGF信号通路的抑制,促进肿瘤细胞增殖和转移。 | 较强研究证据 |
| 肺癌 | PDGFRL在肺癌组织中表达降低,与肿瘤分期和预后相关。 | 较强研究证据 |
| 肝细胞癌 | PDGFRL表达下调与肝癌的侵袭性和不良预后相关。 | 潜在关联 |
| 乳腺癌 | PDGFRL在乳腺癌中表达异常,可能参与肿瘤发生发展。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1A>G (p.Met1Val) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失 |
| c.100C>T (p.Arg34Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,功能丧失 |
| c.200delA (p.Asn67ThrfsTer5) | 移码突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
PDGFRL的失功能突变(如无义、移码)导致蛋白功能丧失,可能解除对PDGF信号通路的抑制,促进细胞增殖。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明PDGFRL存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明PDGFRL存在显性负效应突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0007165 (signal transduction) |
| • GO:0043066 (negative regulation of apoptotic process) | • GO:0008285 (negative regulation of cell population proliferation) |
相关通路
• hsa04060 (Cytokine-cytokine receptor interaction)
• hsa05200 (Pathways in cancer)
蛋白质功能简介
PDGFRL蛋白由515个氨基酸组成,包含一个胞外区域、一个跨膜区域和一个胞内区域。胞外区域含有免疫球蛋白样结构域,可能参与配体结合。由于缺乏酪氨酸激酶结构域,PDGFRL不能传递磷酸化信号,但可能通过竞争性结合PDGF配体或与PDGFRB形成异源二聚体来抑制PDGF信号通路。PDGFRL在多种正常组织中表达,在肿瘤中常下调,提示其作为肿瘤抑制因子的潜在作用。