PDGFRL基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

PDGFRL基因编码血小板衍生生长因子受体样蛋白,参与细胞增殖调控,与多种癌症相关。

基因信息卡

基因符号 PDGFRL
基因全名 platelet derived growth factor receptor like
基因类型 protein coding
染色体位置 8p21.3
NCBI Gene ID 5157 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5157
Ensembl ID ENSG00000104447
UniProt ID Q15198
OMIM ID 604584
HGNC ID 8803
基因别名 PDGRL

基因功能与研究简介

PDGFRL基因编码血小板衍生生长因子受体样蛋白,该蛋白与血小板衍生生长因子受体β(PDGFRB)具有高度同源性,但缺乏酪氨酸激酶活性。PDGFRL蛋白可能作为PDGFRB的负调控因子,通过竞争性结合PDGF配体或形成无活性异源二聚体来抑制PDGF信号通路,从而调控细胞增殖和分化。研究表明,PDGFRL在多种肿瘤中表达下调或缺失,提示其可能作为肿瘤抑制基因发挥作用。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
结直肠癌 PDGFRL表达下调或缺失,可能通过解除对PDGF信号通路的抑制,促进肿瘤细胞增殖和转移。 较强研究证据
肺癌 PDGFRL在肺癌组织中表达降低,与肿瘤分期和预后相关。 较强研究证据
肝细胞癌 PDGFRL表达下调与肝癌的侵袭性和不良预后相关。 潜在关联
乳腺癌 PDGFRL在乳腺癌中表达异常,可能参与肿瘤发生发展。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
结肠 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
乳腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HCT116 暂无可靠数据 结直肠癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1A>G (p.Met1Val) 错义突变 罕见 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失
c.100C>T (p.Arg34Ter) 无义突变 罕见 导致截短蛋白,功能丧失
c.200delA (p.Asn67ThrfsTer5) 移码突变 罕见 导致截短蛋白,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

PDGFRL的失功能突变(如无义、移码)导致蛋白功能丧失,可能解除对PDGF信号通路的抑制,促进细胞增殖。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明PDGFRL存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明PDGFRL存在显性负效应突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0007165 (signal transduction)
• GO:0043066 (negative regulation of apoptotic process) • GO:0008285 (negative regulation of cell population proliferation)

相关通路

hsa04060 (Cytokine-cytokine receptor interaction)
hsa05200 (Pathways in cancer)

蛋白质功能简介

PDGFRL蛋白由515个氨基酸组成,包含一个胞外区域、一个跨膜区域和一个胞内区域。胞外区域含有免疫球蛋白样结构域,可能参与配体结合。由于缺乏酪氨酸激酶结构域,PDGFRL不能传递磷酸化信号,但可能通过竞争性结合PDGF配体或与PDGFRB形成异源二聚体来抑制PDGF信号通路。PDGFRL在多种正常组织中表达,在肿瘤中常下调,提示其作为肿瘤抑制因子的潜在作用。

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