PDK3基因|功能、疾病关联、突变与代谢研究

PDK3编码丙酮酸脱氢酶激酶3,是调控糖代谢与能量稳态的关键酶,其异常与多种疾病相关。

基因信息卡

基因符号 PDK3
基因全名 Pyruvate Dehydrogenase Kinase 3
基因类型 protein-coding
染色体位置 Xp22.11
NCBI Gene ID 5165 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5165
Ensembl ID ENSG00000067992
UniProt ID Q15120
OMIM ID 300906
HGNC ID 8810
基因别名 GSK3B, PDK3, pyruvate dehydrogenase kinase isoform 3

基因功能与研究简介

PDK3基因编码丙酮酸脱氢酶激酶3,属于线粒体蛋白,催化丙酮酸脱氢酶复合体(PDC)的磷酸化,从而抑制其活性,调节糖代谢与能量产生。PDK3在多种组织中表达,尤其在心脏、骨骼肌和肝脏中高表达。其表达受缺氧、营养状态等因素调控,参与细胞代谢重编程。PDK3异常与癌症、神经退行性疾病、代谢性疾病等相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 PDK3在多种肿瘤中高表达,通过抑制PDC促进糖酵解,支持肿瘤细胞增殖(Warburg效应)。 较强研究证据
神经退行性疾病 PDK3表达异常可能影响神经元能量代谢,与阿尔茨海默病等神经退行性疾病相关。 潜在关联
代谢综合征 PDK3参与胰岛素抵抗和脂质代谢,可能影响2型糖尿病等代谢疾病。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
心脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
骨骼肌 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1A>G (p.Met1Val) 错义突变 罕见 可能影响蛋白翻译起始,导致功能丧失
c.100C>T (p.Arg34Trp) 错义突变 罕见 可能影响激酶活性,功能未知
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,导致PDK3活性降低或缺失,可能影响代谢调控。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变,增强PDK3活性,可能促进肿瘤代谢重编程。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变,突变蛋白干扰正常PDK3功能,可能影响PDC活性。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0004672 (protein kinase activity) • GO:0004740 (pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) kinase activity)
• GO:0005739 (mitochondrion) • GO:0006006 (glucose metabolic process)
• GO:0016310 (phosphorylation)

相关通路

Pyruvate metabolism (KEGG: hsa00620)
Glycolysis / Gluconeogenesis (KEGG: hsa00010)
Insulin signaling pathway (KEGG: hsa04910)

蛋白质功能简介

PDK3蛋白由406个氨基酸组成,属于线粒体丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶家族。它通过磷酸化丙酮酸脱氢酶复合体的E1α亚基(PDHA1)的特定丝氨酸残基,抑制PDC活性,从而调节丙酮酸进入三羧酸循环。PDK3在缺氧条件下表达上调,促进糖酵解,减少氧化磷酸化,有助于细胞适应低氧环境。其活性受多种代谢物和信号通路调控。

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