PDZD7基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
PDZD7基因编码PDZ结构域蛋白,参与纤毛形成和听力维持,其突变与非综合征性听力损失相关。
基因信息卡
| 基因符号 | PDZD7 |
|---|---|
| 基因全名 | PDZ domain containing 7 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 10q24.31 |
| NCBI Gene ID | 79955 ncbi.nlm.nih.gov/gene/79955 |
| Ensembl ID | ENSG00000120093 |
| UniProt ID | Q9H5P4 |
| OMIM ID | 612971 |
| HGNC ID | 26270 |
| 基因别名 | DFNB57, PDZ domain-containing protein 7 |
基因功能与研究简介
PDZD7基因编码PDZ结构域蛋白,属于PDZ蛋白家族。该蛋白含有多个PDZ结构域,参与蛋白质-蛋白质相互作用,在纤毛形成和听觉毛细胞功能中发挥重要作用。PDZD7突变与非综合征性听力损失(DFNB57)相关,可能通过影响纤毛结构和功能导致听力障碍。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 非综合征性听力损失(DFNB57) | PDZD7突变导致纤毛蛋白复合物异常,影响内耳毛细胞纤毛的发育和功能,从而引起听力损失。 | 已明确致病 |
| Usher综合征(潜在关联) | PDZD7与USH2A等蛋白相互作用,可能参与Usher综合征的病理过程,但证据尚不充分。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 内耳 | 暂无可靠数据 | 高表达(基于RNA和蛋白研究) |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| IMR-90 | 暂无可靠数据 | 成纤维细胞 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.238C>T (p.Arg80Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1000C>T (p.Arg334Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1234delA (p.Thr412ProfsTer23) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
导致蛋白质截短或功能丧失,破坏纤毛结构,引起听力损失。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005929 (cilium) |
| • GO:0007605 (sensory perception of sound) | • GO:0005737 (cytoplasm) |
相关通路
• 暂无明确通路
蛋白质功能简介
PDZD7蛋白含有多个PDZ结构域,参与蛋白质复合物的组装,特别是在纤毛中。它与USH2A、GPR98等蛋白相互作用,共同维持纤毛的结构和功能。PDZD7突变导致蛋白功能丧失,影响内耳毛细胞纤毛的发育,进而导致听力损失。