PEPB基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

PEPB基因编码线粒体天冬氨酸氨基转移酶,参与氨基酸代谢和尿素循环,其突变可能导致谷草转氨酶缺乏症。

基因信息卡

基因符号 PEPB
基因全名 glutamic-oxaloacetic transaminase 2
基因类型 protein-coding
染色体位置 16q21
NCBI Gene ID 2806 ncbi.nlm.nih.gov/gene/2806
Ensembl ID ENSG00000120053
UniProt ID P00505
OMIM ID 138150
HGNC ID 4433
基因别名 GOT2, KAT4, mitAAT

基因功能与研究简介

PEPB基因编码线粒体天冬氨酸氨基转移酶(GOT2),该酶催化天冬氨酸和α-酮戊二酸转化为草酰乙酸和谷氨酸,在氨基酸代谢、尿素循环和苹果酸-天冬氨酸穿梭中发挥关键作用。GOT2是线粒体中的关键酶,参与能量代谢和细胞氧化还原平衡。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
谷草转氨酶缺乏症 PEPB基因突变导致GOT2酶活性降低或缺失,影响氨基酸代谢和尿素循环,导致谷草转氨酶缺乏症,表现为神经系统异常、发育迟缓等。 已明确致病
癌症相关 PEPB在多种癌症中表达异常,可能通过影响代谢重编程促进肿瘤生长,但具体机制尚在研究中。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肝脏 暂无可靠数据 高表达
心脏 暂无可靠数据 高表达
骨骼肌 暂无可靠数据 中等表达
肾脏 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 胚胎肾细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.100A>G (p.Thr34Ala) 错义突变 罕见 可能影响酶活性
c.200C>T (p.Pro67Leu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性
c.300del (p.Gly101ValfsTer5) 移码突变 罕见 导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

导致GOT2酶活性降低或缺失,影响氨基酸代谢和尿素循环。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0004069 (L-aspartate:2-oxoglutarate aminotransferase activity) • GO:0005739 (mitochondrion)
• GO:0006520 (cellular amino acid metabolic process) • GO:0006103 (2-oxoglutarate metabolic process)

相关通路

hsa00250 (Alanine
aspartate and glutamate metabolism)
hsa00220 (Arginine biosynthesis)
hsa01200 (Carbon metabolism)

蛋白质功能简介

PEPB编码的GOT2蛋白是线粒体天冬氨酸氨基转移酶,由430个氨基酸组成,以同源二聚体形式存在。该酶依赖吡哆醛磷酸(PLP)作为辅因子,催化天冬氨酸和α-酮戊二酸的可逆转化。GOT2在氨基酸代谢、尿素循环和苹果酸-天冬氨酸穿梭中起关键作用,对维持细胞能量代谢和氧化还原平衡至关重要。

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