PEX10基因|过氧化物酶体生物发生因子10的功能、疾病关联与突变研究
PEX10是过氧化物酶体生物发生的关键基因,其突变可导致Zellweger谱系障碍,并在癌症中具有潜在作用。
基因信息卡
| 基因符号 | PEX10 |
|---|---|
| 基因全名 | peroxisomal biogenesis factor 10 |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 1p36.32 |
| NCBI Gene ID | 5192 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5192 |
| Ensembl ID | ENSG00000134086 |
| UniProt ID | O60683 |
| OMIM ID | 602859 |
| HGNC ID | 8851 |
| 基因别名 | RNF69, peroxin-10 |
基因功能与研究简介
PEX10基因编码过氧化物酶体生物发生因子10(Peroxin-10),是过氧化物酶体基质蛋白导入机制的重要组成部分。该蛋白具有RING finger结构域,参与过氧化物酶体膜上受体蛋白的泛素化降解,从而调控过氧化物酶体的形成和功能。PEX10突变可导致过氧化物酶体生物发生障碍,引发Zellweger谱系障碍(Zellweger spectrum disorders, ZSD),包括Zellweger综合征、新生儿肾上腺脑白质营养不良和婴儿Refsum病。此外,PEX10在肝细胞癌等肿瘤中表达异常,可能参与肿瘤发生发展。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| Zellweger综合征 | PEX10突变导致过氧化物酶体生物发生缺陷,影响过氧化物酶体代谢功能,导致严重的神经系统发育异常。 | 已明确致病 |
| 新生儿肾上腺脑白质营养不良 | PEX10突变导致过氧化物酶体功能部分缺陷,表现为进行性神经功能障碍和肾上腺功能不全。 | 已明确致病 |
| 婴儿Refsum病 | PEX10突变导致过氧化物酶体功能轻度缺陷,表现为感觉神经性耳聋、视网膜色素变性等。 | 已明确致病 |
| 肝细胞癌 | PEX10在肝细胞癌中表达下调,可能通过影响过氧化物酶体代谢促进肿瘤进展。 | 具有较强研究证据 |
| 其他癌症 | PEX10在多种癌症中表达异常,可能参与肿瘤发生,但具体机制尚不明确。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.799C>T (p.Arg267Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.841C>T (p.Arg281Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.992G>A (p.Trp331Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1123C>T (p.Arg375Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1186C>T (p.Arg396Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1216C>T (p.Arg406Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1228C>T (p.Arg410Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1246C>T (p.Arg416Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1255C>T (p.Arg419Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1267C>T (p.Arg423Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
PEX10突变导致蛋白功能丧失,影响过氧化物酶体生物发生,是Zellweger谱系障碍的主要致病机制。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明PEX10存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明PEX10突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0004842 ubiquitin-protein transferase activity |
| • GO:0005777 peroxisome | • GO:0005778 peroxisomal membrane |
| • GO:0007031 peroxisome organization | • GO:0016567 protein ubiquitination |
| • GO:0042765 peroxisomal membrane protein import |
相关通路
• Peroxisome biogenesis (Reactome: R-HSA-9033241)
• Peroxisomal protein import (Reactome: R-HSA-9033802)
蛋白质功能简介
PEX10蛋白是过氧化物酶体生物发生因子复合物的一部分,位于过氧化物酶体膜上,包含RING finger结构域,具有E3泛素连接酶活性。它参与受体蛋白PEX5和PEX7的泛素化降解,从而调节过氧化物酶体基质蛋白的导入。PEX10功能缺陷导致过氧化物酶体基质蛋白导入受阻,影响脂肪酸β-氧化、过氧化氢代谢等过程,导致Zellweger谱系障碍。