PEX2基因|过氧化物酶体生物发生因子2、疾病关联、突变与功能研究
PEX2基因编码过氧化物酶体生物发生所需的RING型泛素连接酶,其突变可导致过氧化物酶体生物发生障碍,引发Zellweger谱系疾病。
基因信息卡
| 基因符号 | PEX2 |
|---|---|
| 基因全名 | peroxisomal biogenesis factor 2 |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 8q21.13 |
| NCBI Gene ID | 5828 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5828 |
| Ensembl ID | ENSG00000164751 |
| UniProt ID | P28328 |
| OMIM ID | 170993 |
| HGNC ID | 9717 |
| 基因别名 | PBD5A, PMP35, PXMP3 |
基因功能与研究简介
PEX2基因编码过氧化物酶体生物发生因子2(Peroxisomal Biogenesis Factor 2),是过氧化物酶体膜上的RING型泛素连接酶,参与过氧化物酶体基质蛋白的导入过程。PEX2与PEX10和PEX12共同组成RING finger复合物,负责泛素化PEX5受体,从而促进基质蛋白的转运。PEX2基因突变可导致过氧化物酶体生物发生障碍,引发Zellweger谱系疾病(Zellweger spectrum disorders, ZSD),包括Zellweger综合征、新生儿肾上腺脑白质营养不良和婴儿Refsum病。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| Zellweger综合征 | PEX2基因突变导致过氧化物酶体生物发生障碍,影响过氧化物酶体基质蛋白的导入,导致过氧化物酶体功能缺失,引发多系统发育异常。 | 已明确致病 |
| 新生儿肾上腺脑白质营养不良 | PEX2基因突变导致过氧化物酶体功能部分缺失,临床表现较轻,属于Zellweger谱系疾病。 | 已明确致病 |
| 婴儿Refsum病 | PEX2基因突变导致过氧化物酶体功能轻度受损,表现为感官神经性耳聋、视网膜色素变性等。 | 已明确致病 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 人胚胎肾细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.832C>T (p.Arg278Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致蛋白质截短,功能丧失 |
| c.868C>T (p.Arg290Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致蛋白质截短,功能丧失 |
| c.889C>T (p.Arg297Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致蛋白质截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
PEX2基因的致病突变多为功能丧失型突变,导致过氧化物酶体生物发生障碍。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明PEX2存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明PEX2突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0004842 ubiquitin-protein transferase activity |
| • GO:0005778 peroxisomal membrane | • GO:0007031 peroxisome organization |
| • GO:0016567 protein ubiquitination |
相关通路
• Peroxisomal protein import (Reactome: R-HSA-9033241)
• Ubiquitin mediated proteolysis (KEGG: hsa04120)
蛋白质功能简介
PEX2蛋白是过氧化物酶体膜上的RING型泛素连接酶,包含一个RING finger结构域和一个跨膜区。它作为过氧化物酶体基质蛋白导入机制的一部分,与PEX10和PEX12形成复合物,参与PEX5受体的泛素化和循环。PEX2蛋白的突变会导致过氧化物酶体基质蛋白导入缺陷,进而影响过氧化物酶体的功能。
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