PEX3基因|过氧化物酶体生物发生、疾病关联、突变与基因编辑研究

PEX3是过氧化物酶体生物发生因子3,其突变导致Zellweger综合征等过氧化物酶体生物发生障碍,是研究过氧化物酶体形成和功能的关键基因。

基因信息卡

基因符号 PEX3
基因全名 peroxisomal biogenesis factor 3
基因类型 protein-coding
染色体位置 6q24.2
NCBI Gene ID 8504 ncbi.nlm.nih.gov/gene/8504
Ensembl ID ENSG00000034693
UniProt ID P56589
OMIM ID 601498
HGNC ID 8858
基因别名 TRG18

基因功能与研究简介

PEX3基因编码过氧化物酶体生物发生因子3(Peroxisomal Biogenesis Factor 3),是过氧化物酶体膜形成所必需的蛋白质。PEX3参与过氧化物酶体膜的从头合成,通过将PEX19(一种过氧化物酶体膜蛋白受体)招募到过氧化物酶体膜上,从而促进其他过氧化物酶体膜蛋白的插入。PEX3的突变会导致过氧化物酶体生物发生障碍,进而引发一系列疾病,如Zellweger综合征(ZS)、新生儿肾上腺脑白质营养不良(NALD)和婴儿型Refsum病(IRD),这些疾病统称为过氧化物酶体生物发生障碍(PBD)。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
Zellweger综合征 PEX3基因突变导致过氧化物酶体生物发生障碍,影响过氧化物酶体功能,导致多器官发育异常。 已明确致病
新生儿肾上腺脑白质营养不良 PEX3突变导致过氧化物酶体功能缺陷,影响极长链脂肪酸的β-氧化,导致神经系统和肾上腺功能障碍。 已明确致病
婴儿型Refsum病 PEX3突变导致过氧化物酶体功能部分缺陷,表现为感官神经性耳聋、视网膜色素变性等。 已明确致病

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.296delC (p.Pro99LeufsTer2) 移码突变 罕见 Loss of Function
c.1A>G (p.Met1?) 起始密码子突变 罕见 Loss of Function
c.808C>T (p.Arg270Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

PEX3突变通常导致功能丧失,影响过氧化物酶体膜形成,导致过氧化物酶体缺失或减少。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明PEX3存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明PEX3突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005778 (peroxisomal membrane) • GO:0005779 (integral component of peroxisomal membrane)
• GO:0005515 (protein binding) • GO:0007031 (peroxisome organization)
• GO:0016020 (membrane)

相关通路

Peroxisome biogenesis (Reactome: R-HSA-9033241)
Peroxisomal protein import (Reactome: R-HSA-9033802)

蛋白质功能简介

PEX3蛋白是过氧化物酶体膜上的一个整合膜蛋白,其N端位于细胞质,C端位于过氧化物酶体腔。PEX3与PEX19相互作用,PEX19作为分子伴侣将PEX3靶向到过氧化物酶体膜,并参与其他过氧化物酶体膜蛋白的插入。PEX3的缺失会导致过氧化物酶体膜无法形成,进而影响过氧化物酶体的功能,包括脂肪酸β-氧化、过氧化氢的分解等。

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