PGAP6基因|功能、疾病关联、突变与细胞模型研究
PGAP6编码GPI锚定蛋白重塑酶,参与细胞表面蛋白调控,与多种疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | PGAP6 |
|---|---|
| 基因全名 | post-GPI attachment to proteins 6 |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 16p13.3 |
| NCBI Gene ID | 84927 ncbi.nlm.nih.gov/gene/84927 |
| Ensembl ID | ENSG00000161980 |
| UniProt ID | Q9HCN6 |
| OMIM ID | 611954 |
| HGNC ID | 25706 |
| 基因别名 | TMEM8A, C16orf30 |
基因功能与研究简介
PGAP6(post-GPI attachment to proteins 6)编码一种内质网相关的GPI锚定蛋白重塑酶,属于金属蛋白酶家族,负责去除GPI锚定蛋白上的不饱和脂肪酸,从而影响蛋白质的成熟和运输。该基因的突变可能导致GPI锚定蛋白生物合成缺陷,进而引发多种疾病。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 高IgE综合征(Hyper IgE syndrome) | PGAP6基因突变导致GPI锚定蛋白重塑异常,影响免疫细胞功能,与常染色体隐性遗传的高IgE综合征相关。 | ClinVar, OMIM |
| 发育迟缓(Developmental delay) | PGAP6突变可能影响神经发育,导致智力障碍和发育迟缓。 | ClinVar |
| 免疫缺陷(Immunodeficiency) | GPI锚定蛋白异常影响免疫细胞表面分子表达,导致免疫功能缺陷。 | OMIM |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脾 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.286C>T (p.Arg96Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.494G>A (p.Trp165Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1045C>T (p.Arg349Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能缺失):导致PGAP6蛋白功能丧失,影响GPI锚定蛋白重塑,导致疾病。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0008237 (metallopeptidase activity) | • GO:0006508 (proteolysis) |
| • GO:0016021 (integral component of membrane) | • GO:0005783 (endoplasmic reticulum) |
相关通路
• GPI-anchor biosynthesis (Reactome: R-HSA-162582)
蛋白质功能简介
PGAP6蛋白是一种内质网驻留的金属蛋白酶,属于MEROPS M28家族,参与GPI锚定蛋白的成熟过程。它通过去除GPI锚上的不饱和脂肪酸,促进GPI锚定蛋白从内质网到高尔基体的运输。该蛋白的突变会导致GPI锚定蛋白加工异常,进而影响多种细胞功能。