PGAP6基因|功能、疾病关联、突变与细胞模型研究

PGAP6编码GPI锚定蛋白重塑酶,参与细胞表面蛋白调控,与多种疾病相关。

基因信息卡

基因符号 PGAP6
基因全名 post-GPI attachment to proteins 6
基因类型 protein coding
染色体位置 16p13.3
NCBI Gene ID 84927 ncbi.nlm.nih.gov/gene/84927
Ensembl ID ENSG00000161980
UniProt ID Q9HCN6
OMIM ID 611954
HGNC ID 25706
基因别名 TMEM8A, C16orf30

基因功能与研究简介

PGAP6(post-GPI attachment to proteins 6)编码一种内质网相关的GPI锚定蛋白重塑酶,属于金属蛋白酶家族,负责去除GPI锚定蛋白上的不饱和脂肪酸,从而影响蛋白质的成熟和运输。该基因的突变可能导致GPI锚定蛋白生物合成缺陷,进而引发多种疾病。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
高IgE综合征(Hyper IgE syndrome) PGAP6基因突变导致GPI锚定蛋白重塑异常,影响免疫细胞功能,与常染色体隐性遗传的高IgE综合征相关。 ClinVar, OMIM
发育迟缓(Developmental delay) PGAP6突变可能影响神经发育,导致智力障碍和发育迟缓。 ClinVar
免疫缺陷(Immunodeficiency) GPI锚定蛋白异常影响免疫细胞表面分子表达,导致免疫功能缺陷。 OMIM

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.286C>T (p.Arg96Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.494G>A (p.Trp165Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.1045C>T (p.Arg349Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能缺失):导致PGAP6蛋白功能丧失,影响GPI锚定蛋白重塑,导致疾病。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0008237 (metallopeptidase activity) • GO:0006508 (proteolysis)
• GO:0016021 (integral component of membrane) • GO:0005783 (endoplasmic reticulum)

相关通路

GPI-anchor biosynthesis (Reactome: R-HSA-162582)

蛋白质功能简介

PGAP6蛋白是一种内质网驻留的金属蛋白酶,属于MEROPS M28家族,参与GPI锚定蛋白的成熟过程。它通过去除GPI锚上的不饱和脂肪酸,促进GPI锚定蛋白从内质网到高尔基体的运输。该蛋白的突变会导致GPI锚定蛋白加工异常,进而影响多种细胞功能。

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