PGBD3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

PGBD3是一种piggyBac转座子衍生基因,参与DNA修复和基因调控,与多种疾病相关。

基因信息卡

基因符号 PGBD3
基因全名 piggyBac transposable element derived 3
基因类型 protein-coding
染色体位置 11q13.1
NCBI Gene ID 267004 ncbi.nlm.nih.gov/gene/267004
Ensembl ID ENSG00000137710
UniProt ID Q8N6M6
OMIM ID 611248
HGNC ID 30005
基因别名 CED, dJ756N5.1

基因功能与研究简介

PGBD3(piggyBac转座子衍生3)基因编码一种含有piggyBac转座酶结构域的蛋白质。该蛋白可能参与DNA修复和基因调控。PGBD3与多种疾病相关,包括某些癌症和自身免疫性疾病。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 PGBD3可能通过影响基因组稳定性参与癌症发生,但具体机制尚不明确。 具有较强研究证据
自身免疫性疾病 PGBD3可能参与免疫调节,与某些自身免疫性疾病相关。 潜在关联
神经系统疾病 PGBD3在神经组织中有表达,可能影响神经发育或功能。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
K562 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Thr412Ala) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白功能
c.567del (p.Gly190ValfsTer23) 移码突变 暂无可靠数据 可能导致功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变可能导致PGBD3蛋白功能缺失,影响DNA修复和基因调控。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得型突变可能增强PGBD3的异常活性,导致基因组不稳定。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变可能干扰正常PGBD3功能,影响细胞稳态。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003677 (DNA binding) • GO:0005515 (protein binding)
• GO:0005634 (nucleus) • GO:0006281 (DNA repair)

相关通路

hsa03430 (Mismatch repair)
hsa03420 (Nucleotide excision repair)

蛋白质功能简介

PGBD3蛋白含有piggyBac转座酶结构域,可能参与DNA结合和修复过程。其具体功能尚需进一步研究。

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