PGLYRP4基因|基因功能、疾病关联、突变与免疫研究

PGLYRP4编码肽聚糖识别蛋白4,参与先天免疫应答,与炎症性肠病等疾病相关。

基因信息卡

基因符号 PGLYRP4
基因全名 peptidoglycan recognition protein 4
基因类型 protein-coding
染色体位置 1q21.3
NCBI Gene ID 57115 ncbi.nlm.nih.gov/gene/57115
Ensembl ID ENSG00000163293
UniProt ID Q96LB8
OMIM ID 608610
HGNC ID 30013
基因别名 PGRP-I beta, PGRP-Iβ, PGLYRPIβ, PGRP-Iβ

基因功能与研究简介

PGLYRP4(肽聚糖识别蛋白4)属于肽聚糖识别蛋白(PGLYRP)家族,编码的蛋白质具有两个C端肽聚糖结合结构域,能够识别细菌细胞壁的肽聚糖,参与先天免疫应答。该基因位于染色体1q21.3,该区域包含多个与免疫相关的基因。PGLYRP4在多种组织中表达,尤其在皮肤、肠道和口腔等屏障组织中高表达,可能在抵御微生物感染和调节炎症反应中发挥作用。研究表明,PGLYRP4的变异与炎症性肠病(IBD)等疾病相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
炎症性肠病 PGLYRP4基因变异可能影响肽聚糖识别功能,导致肠道菌群失调和异常免疫应答,从而增加IBD风险。 较强研究证据
银屑病 PGLYRP4位于1q21.3区域,该区域与银屑病易感性相关,但具体机制尚不明确。 潜在关联
癌症 暂无明确证据表明PGLYRP4直接参与癌症发生,但免疫调节可能间接影响肿瘤微环境。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
皮肤 暂无可靠数据 暂无可靠数据
小肠 暂无可靠数据 暂无可靠数据
结肠 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
脾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
角质形成细胞 暂无可靠数据 皮肤屏障细胞
肠上皮细胞 暂无可靠数据 肠道屏障细胞
单核细胞 暂无可靠数据 免疫细胞
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
rs10888331 SNP 未知 可能影响基因表达或剪接,与IBD关联
rs291102 SNP 未知 可能影响蛋白功能,与银屑病关联
暂无明确致病突变 暂无 暂无 暂无
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能缺失型突变):导致PGLYRP4蛋白表达减少或功能丧失,可能削弱对肽聚糖的识别,影响免疫防御。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得型突变):目前尚无明确证据表明PGLYRP4存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性突变):目前尚无明确证据表明PGLYRP4存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0005576 extracellular region
• GO:0005886 plasma membrane • GO:0006955 immune response
• GO:0016020 membrane • GO:0042834 peptidoglycan binding

相关通路

hsa04620 Toll-like receptor signaling pathway
hsa04621 NOD-like receptor signaling pathway

蛋白质功能简介

PGLYRP4蛋白属于肽聚糖识别蛋白家族,具有两个PGRP结构域,能够结合细菌肽聚糖。该蛋白主要表达于皮肤、肠道等屏障组织,参与先天免疫应答,可能通过调节微生物群和炎症反应影响疾病发生。

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