PHACTR2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

PHACTR2基因编码一种与肌动蛋白结合和蛋白磷酸酶1调控相关的蛋白,参与细胞骨架动态和信号转导,与心血管疾病和神经系统疾病相关。

基因信息卡

基因符号 PHACTR2
基因全名 phosphatase and actin regulator 2
基因类型 protein-coding gene
染色体位置 6q24.1
NCBI Gene ID 9749 ncbi.nlm.nih.gov/gene/9749
Ensembl ID ENSG00000111837
UniProt ID Q9C0D0
OMIM ID 608411
HGNC ID 21055
基因别名 RP1-257A7.4, SCAPIN1

基因功能与研究简介

PHACTR2(phosphatase and actin regulator 2)基因编码一种含有RPEL结构域的蛋白,该蛋白能够结合肌动蛋白并调节蛋白磷酸酶1(PP1)的活性。PHACTR2在细胞骨架动态、细胞迁移和信号转导中发挥重要作用。研究表明,PHACTR2与多种疾病相关,包括冠状动脉疾病、偏头痛和神经系统疾病。此外,PHACTR2可能参与调控基因表达和细胞周期。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
冠状动脉疾病 PHACTR2基因变异与冠状动脉疾病风险相关,可能通过影响血管平滑肌细胞功能参与动脉粥样硬化。 GWAS研究证据
偏头痛 PHACTR2基因多态性与偏头痛易感性相关,可能涉及血管舒缩功能异常。 GWAS研究证据
神经系统疾病 PHACTR2在脑组织中高表达,可能参与神经元发育和突触功能,与某些神经发育障碍相关。 表达和功能研究证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
心脏 暂无可靠数据 中等表达
血管 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
肝脏 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HUVEC 暂无可靠数据 内皮细胞
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
rs9349379 SNP 常见(等位基因频率约0.4) 位于内含子,可能影响基因表达,与冠状动脉疾病和偏头痛风险相关
rs12272004 SNP 常见 与冠状动脉疾病相关
rs9349379-A SNP 风险等位基因 增加冠状动脉疾病风险
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

暂无明确证据表明PHACTR2的LoF突变导致疾病,但功能缺失可能影响细胞骨架调控。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明PHACTR2的GoF突变导致疾病。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明PHACTR2的显性负性突变导致疾病。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003779 (actin binding) • GO:0004864 (protein phosphatase inhibitor activity)
• GO:0005737 (cytoplasm) • GO:0005856 (cytoskeleton)
• GO:0005515 (protein binding)

相关通路

hsa04810 (Regulation of actin cytoskeleton)
hsa04010 (MAPK signaling pathway)

蛋白质功能简介

PHACTR2蛋白含有RPEL结构域,能够结合G-肌动蛋白,并调控蛋白磷酸酶1(PP1)的活性。该蛋白可能通过影响肌动蛋白聚合和PP1介导的信号通路,参与细胞迁移、增殖和分化。在血管平滑肌细胞中,PHACTR2可能调节细胞收缩和迁移,从而影响血管功能。

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