PHC3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

PHC3是Polycomb抑制复合物1(PRC1)的核心组分,参与基因沉默和染色质重塑,与多种癌症和发育异常相关。

基因信息卡

基因符号 PHC3
基因全名 polyhomeotic homolog 3
基因类型 protein-coding
染色体位置 3q26.2
NCBI Gene ID 80012 ncbi.nlm.nih.gov/gene/80012
Ensembl ID ENSG00000173889
UniProt ID Q8NDX5
OMIM ID 616905
HGNC ID 15682
基因别名 EDR3, HPH3, FLJ12735

基因功能与研究简介

PHC3(polyhomeotic homolog 3)是Polycomb抑制复合物1(PRC1)的核心组分,参与基因沉默和染色质重塑。PHC3通过其SAM结构域介导蛋白质相互作用,维持靶基因的抑制状态,从而调控细胞分化和发育。PHC3在多种组织中表达,尤其在脑和睾丸中高表达。研究表明,PHC3的异常表达与多种癌症(如前列腺癌、乳腺癌)和神经系统疾病相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
前列腺癌 PHC3表达上调可能促进肿瘤进展,但具体机制尚不明确。 较强研究证据
乳腺癌 PHC3表达异常与乳腺癌的发生发展相关,可能通过调控细胞增殖和凋亡。 较强研究证据
神经发育障碍 PHC3突变可能影响神经发育,但具体关联尚需进一步研究。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
LNCaP 暂无可靠数据 前列腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Thr412Ala) 错义突变 罕见 可能影响蛋白质稳定性
c.2345delC (p.Pro782LeufsTer5) 移码突变 罕见 导致蛋白质截短,可能丧失功能
c.3456G>A (p.Arg1152His) 错义突变 罕见 可能影响SAM结构域功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

移码突变和截短突变可能导致PHC3功能丧失,影响PRC1复合物的正常功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

目前暂无明确证据表明PHC3存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

某些错义突变可能干扰PRC1复合物的组装,产生显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 protein binding • GO:0005634 nucleus
• GO:0006325 chromatin organization • GO:0006355 regulation of transcription
• DNA-templated • GO:0035102 PRC1 complex

相关通路

hsa04110 Cell cycle
hsa05200 Pathways in cancer
hsa05215 Prostate cancer

蛋白质功能简介

PHC3蛋白属于Polycomb组(PcG)蛋白家族,包含SAM结构域和锌指结构域。作为PRC1复合物的核心组分,PHC3参与组蛋白H2A的泛素化修饰,从而介导基因沉默。PHC3在细胞分化、发育和肿瘤发生中发挥重要作用。

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