PHF3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

PHF3是一种转录调控因子,参与基因表达调控和DNA损伤应答,与神经发育和癌症相关。

基因信息卡

基因符号 PHF3
基因全名 PHD Finger Protein 3
基因类型 protein-coding
染色体位置 6q12
NCBI Gene ID 23469 ncbi.nlm.nih.gov/gene/23469
Ensembl ID ENSG00000118495
UniProt ID Q92576
OMIM ID 616785
HGNC ID 25132
基因别名 KIAA0242

基因功能与研究简介

PHF3(PHD Finger Protein 3)是一种含有PHD指结构域的蛋白质,主要定位于细胞核,参与转录调控和DNA损伤应答。PHF3通过其PHD结构域识别组蛋白修饰,调控基因表达,并在神经发育和癌症中发挥重要作用。研究表明,PHF3的突变与神经发育障碍和某些癌症相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经发育障碍 PHF3突变可能导致转录调控异常,影响神经发育,但具体机制尚在研究中。 较强研究证据
癌症 PHF3在多种癌症中表达异常,可能通过调控基因表达影响肿瘤发生发展。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Lys412Glu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.2345delC (p.Pro782LeufsTer5) 移码突变 罕见 导致蛋白截短,可能丧失功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失突变,如移码突变导致蛋白截短,可能丧失转录调控功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005634 (nucleus)
• GO:0006355 (regulation of transcription • DNA-templated)
• GO:0006974 (cellular response to DNA damage stimulus)

相关通路

hsa:04110 (Cell cycle)
hsa:04115 (p53 signaling pathway)

蛋白质功能简介

PHF3蛋白包含PHD指结构域,能够识别组蛋白H3K4me3等修饰,参与转录激活或抑制。此外,PHF3还参与DNA损伤应答,可能通过调控基因表达影响细胞周期和凋亡。

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