PHF5A基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

PHF5A是剪接体U2 snRNP复合物的核心组分,通过调控RNA剪接影响细胞增殖、凋亡及肿瘤发生,是癌症研究的重要靶点。

基因信息卡

基因符号 PHF5A
基因全名 PHD finger protein 5A
基因类型 protein-coding
染色体位置 22q13.2
NCBI Gene ID 84844 ncbi.nlm.nih.gov/gene/84844
Ensembl ID ENSG00000100360
UniProt ID Q7RTV0
OMIM ID 暂无可靠数据
HGNC ID 24952
基因别名 bK223H9.2, INO80H, Rds3

基因功能与研究简介

PHF5A(PHD finger protein 5A)基因编码一种含有PHD指状结构域的蛋白质,是剪接体U2 snRNP复合物的核心组分。PHF5A在RNA剪接过程中发挥关键作用,参与前体mRNA的剪接调控,影响基因表达的多样性。研究表明,PHF5A在多种肿瘤中高表达,与肿瘤细胞的增殖、凋亡和转移密切相关。此外,PHF5A还参与DNA损伤修复、细胞周期调控等过程,是癌症治疗和诊断的潜在靶点。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症(多种类型) PHF5A在多种癌症中高表达,通过调控RNA剪接影响肿瘤相关基因的表达,促进肿瘤发生发展。 较强研究证据
肝细胞癌 PHF5A在肝细胞癌中表达上调,通过调节剪接因子影响细胞增殖和凋亡,与不良预后相关。 较强研究证据
乳腺癌 PHF5A在乳腺癌中高表达,可能通过调控剪接影响肿瘤抑制基因的表达,促进肿瘤进展。 潜在关联
结直肠癌 PHF5A在结直肠癌中表达升高,与肿瘤分期和预后相关,可能通过剪接调控影响肿瘤生长。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
骨髓 暂无可靠数据 暂无可靠数据
淋巴结 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
HCT116 暂无可靠数据 结直肠癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1A>G (p.Met1Val) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白质翻译起始,导致功能异常
c.2T>C (p.Met1Thr) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白质翻译起始,导致功能异常
c.3G>A (p.Met1Ile) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白质翻译起始,导致功能异常
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失突变:导致PHF5A蛋白功能丧失或减弱,可能影响剪接体功能,导致RNA剪接异常。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得突变:增强PHF5A的活性或稳定性,可能促进肿瘤发生。目前暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变:突变蛋白干扰正常PHF5A功能,可能影响剪接体组装。目前暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0000398 (mRNA splicing • via spliceosome)
• GO:0005681 (spliceosomal complex) • GO:0005515 (protein binding)
• GO:0044822 (poly(A) RNA binding)

相关通路

hsa03040 (Spliceosome)
hsa04110 (Cell cycle)
hsa05200 (Pathways in cancer)

蛋白质功能简介

PHF5A蛋白含有PHD指状结构域,是剪接体U2 snRNP复合物的核心组分。它参与前体mRNA的剪接过程,通过识别和结合RNA,调控剪接位点的选择。PHF5A还参与DNA损伤修复和细胞周期调控,通过与INO80复合物相互作用,影响染色质重塑。在肿瘤中,PHF5A的异常表达或突变可能导致剪接异常,进而影响肿瘤相关基因的表达,促进肿瘤发生发展。

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