PHGR1基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究

PHGR1(proline/histidine/glycine-rich 1)是一种富含脯氨酸/组氨酸/甘氨酸的蛋白质,在胃肠道中高表达,可能参与细胞增殖和分化调控,与结直肠癌等疾病相关。

基因信息卡

基因符号 PHGR1
基因全名 proline/histidine/glycine-rich 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 15q15.1
NCBI Gene ID 64412 ncbi.nlm.nih.gov/gene/64412
Ensembl ID ENSG00000137807
UniProt ID Q6NSJ2
OMIM ID 617753
HGNC ID 24966
基因别名 C15orf21, PRGR1

基因功能与研究简介

PHGR1(proline/histidine/glycine-rich 1)基因编码一种富含脯氨酸、组氨酸和甘氨酸的蛋白质。该蛋白在胃肠道组织中高表达,可能参与细胞增殖和分化的调控。研究表明PHGR1在结直肠癌中表达下调,可能作为肿瘤抑制因子。此外,PHGR1可能参与Wnt信号通路的调控。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
结直肠癌 PHGR1在结直肠癌中表达下调,可能通过影响Wnt信号通路参与肿瘤发生,具有潜在抑癌作用。 较强研究证据
胃癌 PHGR1在胃癌组织中表达降低,与肿瘤分期和预后相关,可能作为预后标志物。 潜在关联
炎症性肠病 PHGR1在炎症性肠病中表达异常,可能参与肠道炎症反应。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
小肠 暂无可靠数据 高表达
结肠 暂无可靠数据 高表达
直肠 暂无可靠数据 高表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
Caco-2 暂无可靠数据 结直肠腺癌细胞系
HT-29 暂无可靠数据 结直肠腺癌细胞系
HCT116 暂无可靠数据 结直肠癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1A>G (p.Met1Val) 错义突变 罕见 可能影响蛋白质翻译起始,导致功能丧失
c.256C>T (p.Arg86Ter) 无义突变 罕见 导致提前终止密码子,产生截短蛋白,可能丧失功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

PHGR1的错义突变或无义突变可能导致蛋白质功能丧失,影响其正常调控作用,与结直肠癌等疾病相关。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明PHGR1存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明PHGR1存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005737 (cytoplasm)
• GO:0005634 (nucleus)

相关通路

Wnt signaling pathway (WP428)

蛋白质功能简介

PHGR1蛋白由约200个氨基酸组成,富含脯氨酸、组氨酸和甘氨酸。该蛋白定位于细胞质和细胞核,可能参与蛋白质-蛋白质相互作用。在胃肠道组织中高表达,可能通过调控Wnt信号通路影响细胞增殖和分化。

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