PHGR1基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究

PHGR1(proline/histidine/glycine-rich 1)是一种富含脯氨酸/组氨酸/甘氨酸的蛋白质,在胃肠道中高表达,可能参与细胞增殖和分化调控,与结直肠癌等疾病相关。

基因信息卡

基因符号 PHGR1
基因全名 proline/histidine/glycine-rich 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 15q15.1
NCBI Gene ID 64412 ncbi.nlm.nih.gov/gene/64412
Ensembl ID ENSG00000137807
UniProt ID Q6NSJ2
OMIM ID 617753
HGNC ID 24966
基因别名 C15orf21, PRGR1

基因功能与研究简介

PHGR1(proline/histidine/glycine-rich 1)基因编码一种富含脯氨酸、组氨酸和甘氨酸的蛋白质。该蛋白在胃肠道组织中高表达,可能参与细胞增殖和分化的调控。研究表明PHGR1在结直肠癌中表达下调,可能作为肿瘤抑制因子。此外,PHGR1可能参与Wnt信号通路的调控。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
结直肠癌 PHGR1在结直肠癌中表达下调,可能通过影响Wnt信号通路参与肿瘤发生,具有潜在抑癌作用。 较强研究证据
胃癌 PHGR1在胃癌组织中表达降低,与肿瘤分期和预后相关,可能作为预后标志物。 潜在关联
炎症性肠病 PHGR1在炎症性肠病中表达异常,可能参与肠道炎症反应。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
胃 暂无可靠数据 高表达
小肠 暂无可靠数据 高表达
结肠 暂无可靠数据 高表达
直肠 暂无可靠数据 高表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
Caco-2 暂无可靠数据 结直肠腺癌细胞系
HT-29 暂无可靠数据 结直肠腺癌细胞系
HCT116 暂无可靠数据 结直肠癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1A>G (p.Met1Val) 错义突变 罕见 可能影响蛋白质翻译起始,导致功能丧失
c.256C>T (p.Arg86Ter) 无义突变 罕见 导致提前终止密码子,产生截短蛋白,可能丧失功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

PHGR1的错义突变或无义突变可能导致蛋白质功能丧失,影响其正常调控作用,与结直肠癌等疾病相关。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明PHGR1存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明PHGR1存在显性负性突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005737 (cytoplasm)
• GO:0005634 (nucleus)

相关通路

• Wnt signaling pathway (WP428)

蛋白质功能简介

PHGR1蛋白由约200个氨基酸组成,富含脯氨酸、组氨酸和甘氨酸。该蛋白定位于细胞质和细胞核,可能参与蛋白质-蛋白质相互作用。在胃肠道组织中高表达,可能通过调控Wnt信号通路影响细胞增殖和分化。

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