PHYH基因|功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

PHYH基因编码植烷酰辅酶A羟化酶,参与植烷酸α-氧化,其缺陷导致Refsum病。

基因信息卡

基因符号 PHYH
基因全名 phytanoyl-CoA 2-hydroxylase
基因类型 protein coding
染色体位置 10p13
NCBI Gene ID 5264 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5264
Ensembl ID ENSG00000165617
UniProt ID O14832
OMIM ID 602026
HGNC ID 8940
基因别名 PAHX, phytanoyl-CoA dioxygenase, phytanoyl-CoA hydroxylase

基因功能与研究简介

PHYH基因编码植烷酰辅酶A羟化酶,该酶催化植烷酸α-氧化途径中的第一步反应,将植烷酰辅酶A转化为2-羟基植烷酰辅酶A。植烷酸是一种支链脂肪酸,主要来源于饮食中的叶绿醇。PHYH缺陷导致植烷酸在体内积累,引起Refsum病(成人Refsum病)。该基因突变可导致酶活性丧失,影响过氧化物酶体功能。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
Refsum病 PHYH基因突变导致植烷酰辅酶A羟化酶活性缺失,植烷酸α-氧化受阻,植烷酸在血浆和组织中积累,引起过氧化物酶体功能障碍,导致视网膜色素变性、周围神经病变、小脑性共济失调等。 已明确致病
成人Refsum病 PHYH基因突变是成人Refsum病的主要病因,遗传方式为常染色体隐性遗传。 已明确致病

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肝脏 暂无可靠数据 高表达
肾脏 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
心脏 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 胚胎肾细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.164A>G (p.Tyr55Cys) 错义突变 罕见 可能影响酶活性
c.215C>T (p.Pro72Leu) 错义突变 罕见 可能影响酶活性
c.286G>A (p.Gly96Arg) 错义突变 罕见 可能影响酶活性
c.404T>C (p.Leu135Pro) 错义突变 罕见 可能影响酶活性
c.135+1G>A 剪接突变 罕见 可能影响mRNA剪接
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

大多数PHYH突变导致酶活性丧失或降低,属于功能缺失型突变。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明PHYH突变具有功能获得效应。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明PHYH突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005506 iron ion binding • GO:0008482 phytonyl-CoA 2-hydroxylase activity
• GO:0005777 peroxisome • GO:0006629 lipid metabolic process
• GO:0006559 fatty acid alpha-oxidation

相关通路

Phytanic acid alpha-oxidation (Reactome: R-HSA-389887)

蛋白质功能简介

PHYH蛋白是一种过氧化物酶体基质蛋白,属于铁依赖性双加氧酶家族。它催化植烷酰辅酶A的2-羟化反应,是植烷酸α-氧化的限速酶。该蛋白含有铁离子结合位点,需要铁离子作为辅因子。PHYH缺陷导致植烷酸积累,引发Refsum病。

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