PIDD1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
PIDD1编码p53诱导死亡结构域蛋白,参与细胞凋亡、DNA损伤应答和NF-κB信号通路,与肿瘤发生及神经发育相关。
基因信息卡
| 基因符号 | PIDD1 |
|---|---|
| 基因全名 | p53-induced death domain protein 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 11p15.5 |
| NCBI Gene ID | 55367 ncbi.nlm.nih.gov/gene/55367 |
| Ensembl ID | ENSG00000138668 |
| UniProt ID | Q9HB75 |
| OMIM ID | 605274 |
| HGNC ID | 26091 |
| 基因别名 | LRDD, PIDD |
基因功能与研究简介
PIDD1基因编码p53诱导死亡结构域蛋白1,该蛋白含有死亡结构域,参与调控细胞凋亡、DNA损伤应答和NF-κB信号通路。PIDD1在多种组织中表达,其功能异常与肿瘤发生、神经发育异常等疾病相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 结直肠癌 | PIDD1表达异常可能影响细胞凋亡和增殖,与肿瘤发生相关。 | 较强研究证据 |
| 神经母细胞瘤 | PIDD1基因拷贝数变异和表达改变与神经母细胞瘤的发病和预后相关。 | 较强研究证据 |
| 乳腺癌 | PIDD1在乳腺癌中表达上调,可能通过抑制凋亡促进肿瘤进展。 | 潜在关联 |
| 肺癌 | PIDD1表达水平与肺癌患者生存期相关,可能作为预后标志物。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 胸腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 小肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 人胚胎肾细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234C>T (p.Arg412Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致截短蛋白,可能影响凋亡功能 |
| c.456_457insA (p.Thr153AsnfsTer5) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function,导致蛋白截短,可能影响功能 |
| c.789A>G (p.Ile263Val) | 错义突变 | 低频 | 可能影响蛋白结构,功能影响未知 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能缺失型突变):导致蛋白功能丧失或减弱,可能影响细胞凋亡和DNA损伤应答。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得型突变):目前暂无明确证据表明PIDD1存在此类突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性突变):目前暂无明确证据表明PIDD1存在此类突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 protein binding | • GO:0006915 apoptotic process |
| • GO:0007249 I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling | • GO:0006974 DNA damage response |
| • signal transduction by p53 class mediator | • GO:0005737 cytoplasm |
| • GO:0005634 nucleus |
相关通路
• PIDDosome pathway (Reactome: R-HSA-5620971)
• p53-dependent G1 DNA damage response (Reactome: R-HSA-69580)
• NF-kappaB signaling (KEGG: hsa04064)
蛋白质功能简介
PIDD1蛋白包含一个死亡结构域,参与形成PIDDosome复合物,激活caspase-2介导的凋亡通路。同时,PIDD1也参与NF-κB信号通路的调控,影响细胞存活和炎症反应。