PIGN基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
PIGN基因编码糖基磷脂酰肌醇锚生物合成途径中的关键酶,其突变与多种先天性糖基化障碍和神经发育疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | PIGN |
|---|---|
| 基因全名 | phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class N |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 18q21.33 |
| NCBI Gene ID | 23556 ncbi.nlm.nih.gov/gene/23556 |
| Ensembl ID | ENSG00000134419 |
| UniProt ID | O95427 |
| OMIM ID | 606097 |
| HGNC ID | 8966 |
| 基因别名 | MCD4, GPIBD12, PIG-N |
基因功能与研究简介
PIGN基因编码糖基磷脂酰肌醇(GPI)锚生物合成途径中的一种酶,具体为磷脂酰肌醇聚糖锚生物合成N类蛋白。该蛋白参与GPI锚的早期合成步骤,将磷酸乙醇胺转移到GPI中间体上。GPI锚是许多细胞表面蛋白(包括粘附分子、受体和酶)附着到细胞膜的重要结构。PIGN基因突变可导致GPI锚合成缺陷,进而影响多种组织的发育和功能。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 多发性先天性畸形-肌张力低下-癫痫综合征1型(MCSZ1) | 已明确致病 | OMIM 614080 |
| GPI生物合成缺陷12型(GPIBD12) | 已明确致病 | OMIM 614080 |
| 神经发育障碍 | 具有较强研究证据 | ClinVar |
| 先天性糖基化障碍 | 具有较强研究证据 | OMIM |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| K562 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1000C>T (p.Arg334Ter) | 无义突变 | 暂无可靠数据 | Loss of Function |
| c.1234A>G (p.Lys412Glu) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白功能 |
| c.1555delC (p.Leu519TrpfsTer5) | 移码突变 | 暂无可靠数据 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
导致PIGN蛋白功能丧失或显著降低,影响GPI锚合成,是MCSZ1的主要致病机制。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明PIGN存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明PIGN突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0006506: GPI anchor biosynthetic process | • GO:0016020: membrane |
| • GO:0016740: transferase activity |
相关通路
• GPI anchor biosynthesis (Reactome: R-HSA-162710)
蛋白质功能简介
PIGN蛋白是GPI锚生物合成途径中的一种磷酸乙醇胺转移酶,催化将磷酸乙醇胺添加到GPI中间体上。该蛋白位于内质网膜,是GPI锚合成所必需的。PIGN功能缺陷会导致GPI锚合成受阻,影响多种细胞表面蛋白的膜锚定,进而导致多系统发育异常。